Na veimataqali vakasama ni veitaqomaki ni kau e vakarautaka na idusidusi bibi ni vakasama me baleta na kena vakamacalataki na ivakarau ni metabolism vakatabakidua ni kau, ia na nodra parofisai bibi e se bera tikoga ni vakatovolei. Eke, keitou vakayagataka na vakadidike ni tandem sega ni veivakaduiduitaki (MS / MS) me vakadikevi vakavinaka na metabolome ni tavako attenuated na veimataqali mai na veivunikau yadua ki na iwiliwili kei na veimataqali veiwekani voleka, ka cakacakataka e dua na iwiliwili levu ni vakasama ni ivakatakilakila ni ivakatakilakila ni yavutaki ena spectra ni veivakaduavatataki ena itukutuku. Na ituvatuva me vakatovolei kina na parofisai bibi ni veitaqomaki vinaka duadua (OD) kei na toso ni takete (MT) vakasama. Na itukutuku ni iwasewase ni metabolomics ni kau e salavata kei na vakasama ni OD, ia e veibasai kei na parofisai levu ni vakasama ni MT ena dinamika ni metabolomics e vakavuna na manumanu vuka. Mai na ivakatagedegede ni veisau lailai ki na ivakatagedegede ni veisau lelevu, na sikinala ni jasmonate a vakatakilakilataki me vaka na vakatulewa levu ni OD, ni sikinala ni ethylene e vakarautaka na vakavinakataki ni isau ni herbivore-vakatabakidua e vakamacalataki ena rede ni MS / MS.
Na metabolites vakatabakidua kei na veimataqali ituvatuva era vakaitavi vakalevu ena veisautaki ni kau ki na vanua e tiko kina, vakabibi ena kena taqomaki na meca (1). Na veimataqali veivakurabuitaki ni metabolism vakatabakidua e kune ena kau sa vakauqeta e vicasagavulu na yabaki ni vakadidike titobu ena kena veitikina e vuqa ni cakacaka ni bula, ka sa bulia e dua na lisi balavu ni vakasama ni veitaqomaki ni kau, sai koya na veivakatorocaketaki kei na bula ni veimaliwai ni kau-manumanu lalai. Na vakadidike vakasaenisi e solia na idusidusi bibi (2). Ia, na vakasama ni veitaqomaki ni kau oqo e sega ni muria na sala ni ivakarau ni vakasama deductive vakasama, ena kena sa tiko na parofisai bibi ena ivakatagedegede vata ga ni vakadidike (3) ka ra vakatovolei vakatovotovo me toso ki liu na veisau ka tarava ni veivakatorocaketaki vakasama (4). Na vakaiyalayala ni tekinolaji e vakatabuya na vakasoqoni ni itukutuku ki na veimataqali metabolic vakatabakidua ka sega ni okati kina na vakadidike raraba ni metabolites vakatabakidua, vakakina na kena tarovi na veivakatautauvatataki ni veimataqali ka bibi me baleta na veivakatorocaketaki ni vakasama (5). Na lailai ni itukutuku raraba ni metabolomics kei na dua na ilavo raraba me vakatautauvatataki kina na cakacaka ni kena vakarautaki na vanua ni metabolic ena maliwa ni veimataqali ilawalawa ni kau e vakataotaka na matua vakasaenisi ni vanua.
Na veivakatorocaketaki vou ena vanua ni tandem levu ni spectrometry (MS / MS) metabolomics e rawa ni vakamacalataka vakavinaka na veisau ni metabolic ena loma kei na maliwa ni veimataqali ni dua na clade ni ivakarau soli, ka rawa ni cokovata kei na iwalewale ni vakasama me vakarautaki kina na tautauvata ni ituvatuva ena maliwa ni veiwaki vereverea oqo. Na kila taumada ni kemisitiri (5). Na kena cokovata na tekinolaji torocake ena vakadidike kei na kompiuta e vakarautaka e dua na ituvatuva e gadrevi me baleta na veivakatovolei balavu ni vuqa na parofisai e caka mai na vakasama ni bula kei na veisau ni veimataqali metabolic. Shannon (6) a vakaraitaka na vakasama ni itukutuku ena imatai ni gauna ena nona itukutuku seminal ena 1948, ka vakadavora na yavu ni vakadidike ni fika ni itukutuku, ka sa vakayagataki ena vuqa na vanua e sega ni kena vakayagataki taumada. Ena genomics, na itukutuku ni vakasama sa vakayagataki vakavinaka me vakalevutaka na itukutuku ni veitarataravi ni maroroi (7). Ena vakadidike ni volavola, na itukutuku ni vakasama e vakadikeva na veisau raraba ena volavola (8). Ena vakadidike sa oti, keitou vakayagataka na ituvatuva ni iwiliwili ni itukutuku ni vakasama ki na metabolomics me vakamacalataka na kenadau ni metabolic ni ivakatagedegede ni yago ena veivunikau (9). Eke, eda cokovata na MS / MS-yavutaki na cakacaka kei na ituvatuva ni iwiliwili ni itukutuku ni vakasama, vakatakilakilataki ena veimataqali metabolic ena ilavo raraba, me vakatautauvatataki na parofisai bibi ni vakasama ni veitaqomaki ni kau ni metabolome vakavuna na herbivores.
Na ituvatuva vakasama ni veitaqomaki ni kau e dau veivakaduavatataki ka rawa ni wasei ki na rua na iwasewase: o ira era saga me ra vakamacalataka na veiwasei ni metabolites ni kau-vakatabakidua e yavutaki ena cakacaka ni veitaqomaki, me vaka na veitaqomaki vinaka duadua (OD) (10), toso takete (MT) (11) ) Kei na irairai resources ni so tale na ivurevure ni vakamacala ena, na kena rawati e tara na tubu ni kau kei na kena kumuni na metabolites vakatabakidua, me vaka na kaboni: vakasama ni veivakatautauvatataki ni kakana (13), vakasama ni tubu ni iwiliwili (14 ), kei na tubu kei na veivakaduiduitaki ni veivakatautauvatataki ni vakasama (15). Na rua na ilawalawa ni vakasama e tiko ena duidui na ivakatagedegede ni vakadidike (4). Ia, e rua na vakasama e oka kina na cakacaka ni veitaqomaki ena ivakatagedegede ni cakacaka e lewa na veivosaki me baleta na veitaqomaki ni kau kei na inducible ni kau: OD vakasama, ka nanuma ni kau vakatubuilavo ena nodra veitaqomaki ni kemikali sau levu ena gauna ga e gadrevi kina, me kena ivakaraitaki, ni ra sa ingested Ni dua na manumanu co ravuravu, o koya gona, me vaka na compsibilive kei na cakacaka e lesi (10); na vakasama ni MT e vakatura ni sega ni dua na axis ni veisau ni veidusimaki ni veisau, ia na veisau ni veisau vakaveitalia, ka vakavuna kina na kena rawa ni Vakataotaka na “takete ni toso” ni veisau ni veisau. Ena dua tale na vosa, na rua na vakasama oqo e cakava na veibasai ni parofisai me baleta na veisautaki ni metabolic e yaco ni oti na nodra ravuti na manumanu vuka: na veiwekani ena maliwa ni unidirectional na vakasoqoni vata ni metabolites kei na cakacaka ni veitaqomaki (OD) kei na veisau ni metabolic sega ni vakadodonutaki (MT) (11 ).
Na OD kei na MT vakasama e sega walega ni okati kina na veisau vakauqeti ena metabolome, ia na veika e yaco talega ena veika bula kei na veivakatorocaketaki ni kena kumuni na veika oqo, me vaka na isau ni veisau kei na yaga ni veisau ni veika oqo ena dua na vanua ni bula vakaitaukei (16). E dina ga ni rau kila ruarua na vakasama na cakacaka ni veitaqomaki ni metabolites vakatabakidua, ka rawa se sega ni sau levu, na parofisai bibi e vakaduiduitaka na vakasama ni OD kei na MT e tiko ena veidusimaki ni veisau ni metabolic vakauqeti. Na parofisai ni OD vakasama sa ciqoma na vakasama vakatovotovo duadua me yacova mai oqo. Na veivakatovolei oqo e oka kina na vuli ni vakadodonu se sega ni vakadodonu na cakacaka ni veitaqomaki ni veimataqali tissue ni veivakaduiduitaki vakatabakidua ena greenhouses kei na ituvaki ni bula, ka vakakina na veisau ena ivakatagedegede ni veivakatorocaketaki ni kau (17-19). Ia, me yacova mai oqo, ena vuku ni lailai ni dua na cakacaka kei na ituvatuva ni iwiliwili me baleta na vakadidike raraba ni vuravura raraba ni veimataqali metabolic ni dua na ka bula, na duidui levu ni parofisai ena maliwa ni rua na vakasama (o ya, na veidusimaki ni veisau ni metabolic) e se tikoga me vakatovolei. Eke, keitou vakarautaka e dua na vakadidike vakaoqo.
E dua vei ira na ivakatakilakila bibi duadua ni metabolites ni kau-vakatabakidua na nodra duidui ni ituvatuva vakaitamera ena veimatanitu kecega mai na kau duadua, iwiliwili ki na veimataqali tautauvata (20). E vuqa na veisau ni levu ena metabolites vakatabakidua e rawa ni laurai ena ivakarau ni iwiliwili ni tamata, ni kaukauwa na duidui ni ivakarau e dau maroroi ena ivakatagedegede ni veimataqali (20). O koya gona, na veimataqali metabolic ni kau sa ikoya na tiki levu ni veimataqali cakacaka, vakaraitaka na kena rawa ni veisautaki ki na veimataqali niches, vakabibi o ira na niches kei na veimataqali rawa ni veivakacacani mai vei ira na manumanu lalai vakatabakidua kei na herbivores raraba (21). Me tekivu mai na itukutuku ni Fraenkel (22) ni yavu me baleta na vuna e tiko kina na metabolites ni kau-vakatabakidua, na veimaliwai kei na veimataqali manumanu lalai sa raici me vaka na veivakasaurarataki bibi ni digidigi, kei na veimaliwai oqo e vakabauti ni sa bulia na kau ena gauna ni veisau. Na sala ni veisau (23). Na duidui ni veimataqali ena veimataqali metabolites vakatabakidua e rawa ni vakaraitaka talega na veivakatautauvatataki ni yago e salavata kei na itataqomaki ni kau vakaitamera kei na inducible mai na iwalewale ni herbivorous, me vaka ni rua na mataqali era dau veiwekani ca kei na dua tale (24). E dina ga ni rawa ni yaga me maroroi e dua na itataqomaki vinaka ena veigauna kecega, na veisau ni metabolic ena kena gauna dodonu e salavata kei na itataqomaki e vakarautaka na yaga matata ena kena vakatarai na veivunikau me ra wasea na ivurevure yaga ki na veivakatubuilavo tale eso ni yago (19, 24), ka vakatabuya na kena gadrevi na symbiosis. Na vakacaca ni veivakadeitaki (25). Me kena ikuri, na veivakavoui oqo ni metabolites vakatabakidua e vakavuna na manumanu lalai ni manumanu lalai e rawa ni vakavuna na veiwaseyaki ni veivakarusai ena iwiliwili ni tamata (26), ka rawa ni vakaraitaka na wiliwili vakadodonu ni veisau vakaitamera ni veika bula ena sikinala ni jasmonic acid (JA), ka rawa ni maroroi tiko ena iwiliwili ni tamata. Na sikinala ni JA cecere kei na lailai e veisau-offs ena maliwa ni veitaqomaki mai na manumanu vuka kei na veisisivi kei na veimataqali manumanu vakatabakidua (27). Me kena ikuri, na sala ni biosynthetic ni metabolite vakatabakidua ena sotava na yali totolo kei na veisau ena gauna ni veisau, ka vakavuna na veiwaseyaki ni metabolic patchy ena maliwa ni veimataqali veiwekani voleka (28). Na polymorphisms oqo e rawa ni tauyavutaki vakatotolo ena kena saumi na veisau ni ivakarau ni manumanu vuka (29), kena ibalebale ni veisau ni veivanua ni manumanu vuka e dua na ka bibi e draivataka na duidui ni metabolic.
Eke, keitou sa vakadodonutaka vakatabakidua na leqa oqo. (I) E vakavoutaka vakacava na manumanu lalai dau kania na co na metabolime ni kau? (Ii) Na cava na itukutuku bibi ni veitiki ni palasitika ni metabolic ka rawa ni vakarautaki me vakatovolei kina na parofisai ni vakasama ni veitaqomaki balavu? (Iii) Se me vakavoutaki tale na metabolome ni kau ena dua na sala duatani vua na dauvakacaca, kevaka e vakakina, na itavi cava e vakayacora na hormone ni kau ena kena vakarautaki e dua na isau ni metabolic vakatabakidua, kei na metabolites cava e cau ki na veimataqali vakatabakidua ni veitaqomaki? (Iv) Me vaka ni rawa ni vakabalavutaki na parofisai e cakava e vuqa na vakasama ni veitaqomaki ena veimataqali kece ni veitiki ni bula, keitou taroga na kena tudei na isau ni metabolic e vakavuna mai na veivakatautauvatataki e loma ki na veivakatautauvatataki ni interspecies? Me rawa ni yaco oqo, keitou sa vulica vakavinaka na draunikau ni tavako, ka sa dua na kau ivakaraitaki ni veika bula kei na vutuniyau ni kena vakayagataki vakatabakidua, ka sa yaga sara me baleta na larvae ni rua na manumanu daukana, na Lepidoptera Datura (Ms) (Sa rui kaukauwa, vakabibi na kena laukana) Ena Solanaceae ni littora kei na Spodo “mataqali”, kei na veivunikau ni Solanaceae kei na veivunikau tale eso ni veimataqali kei na matavuvale Kakana ni kau. Keitou parsed na MS / MS metabolomics na ivakarau ka lavelavetaka na itukutuku ni vakasama ni iwiliwili ni ivakamacala me vakatautauvatataki kina na vakasama ni OD kei na MT. Cakava na mape ni veivakadeitaki me vakaraitaka na ivakatakilakila ni metabolites bibi. Na vakadidike e a vakarabailevutaki ki na lewenivanua ni N. nasi kei na veimataqali tavako voleka me vakadikevi tale na covariance ena maliwa ni ivakatakilakila ni homoni ni kau kei na OD ni veivakauqeti.
Me rawa ni tauri e dua na mape raraba me baleta na palasitika kei na ituvatuva ni metabolome ni draunikau ni tavako herbivorous, keitou vakayagataka e dua na vakadidike sa vakatorocaketaki oti kei na cakacaka ni vakasama me vakasoqoni vata ka deconvolute na itukutuku cecere-vakatulewa tu vakataki koya MS / MS spectra mai na veitiki ni kau ( 9). Na iwalewale sega ni vakaduiduitaki oqo (vakatokai na MS/MS) e rawa ni tara na spectra ni veivakaduavatataki sega ni vakalevutaki, ka rawa ni qai vakayagataki me baleta na veivakatarogi kece ni veivakaduavatataki-ivakatagedegede e vakamacalataki eke. Na veivakatorocaketaki ni veivunikau oqo era sa veimataqali, ka oka kina e drau ki na udolu na veivakatorocaketaki (me baleta na 500-1000-s / MS / MS eke). Eke, eda vakasamataka na palasitika ni metabolic ena ituvatuva ni itukutuku ni vakasama, ka vakarautaka na veimataqali kei na kenadau ni metabolome yavutaki ena entropy ni Shannon ni veiwaseyaki ni veisautaki ni veisau. Vakayagataka na fomula sa vakayacori oti (8), keitou vakarautaka e dua na ilawalawa ni ivakatakilakila e rawa ni vakayagataki me vakalevutaki kina na veimataqali metabolome (Hj ivakatakilakila), vakatabakidua ni itukutuku ni metabolic (δj ivakatakilakila) kei na vakatabakidua ni dua ga na metabolite (Si ivakatakilakila) . Me kena ikuri, keitou vakayagataka na ivakatakilakila ni palasitika ni yawa ni veiwekani (RDPI) me vakalevutaka na kena rawa ni vakayagataki na veika bula ni manumanu vuka (iTaba 1A) (30). Ena loma ni ituvatuva ni iwiliwili oqo, eda qarava na MS / MS na spectrum me vaka na yavu ni itukutuku ni iuniti, ka vakayacora na veiwekani ni levu ni MS / MS ki na dua na mape ni veisoliyaki ni veigauna, ka qai vakayagataka na entropy ni Shannon me vakatautauvatataki kina na veimataqali metabolome mai kina. Na metabolome vakatabakidua e vakarautaki ena ivakatautauvata ni dua ga na MS / MS na ivakarau. O koya gona, na tubu ni levu ni so na kalasi ni MS / MS ni oti na kena vakacurumi na herbivore e veisautaki ki na spectral inducibility, RDPI kei na kena vakatabakidua, oya, na kena vakalevutaki na ivakatakilakila ni δj, baleta ni levu cake na metabolites vakatabakidua e caka ka dua na ivakatakilakila cecere ni Si e caka. Na vakalailaitaki ni Hj veimataqali index e vakaraitaka ni se na iwiliwili ni MS/MS e vakatuburi e vakalailaitaki, se na veisau ni veisoliyaki ni itukutuku ni veivakacacani ena dua na veidusimaki lailai ni duavata, ni vakalailaitaka na kena sega ni vakadeitaki raraba. Ena kena vakarautaki na ivakatakilakila ni Si, e rawa ni vakaraitaka na MS/MS cava era vakauqeti mai vei ira eso na herbivores, ena kena veibasai, na MS/MS cava e sega ni sauma na vakauqeti, ka sa dua na ivakatakilakila bibi me vakaduiduitaka na MT kei na OD ni parofisai.
(A) Na ivakamacala ni iwiliwili e vakayagataki me baleta na veikau (H1 ki na Hx) MS / MS itukutuku-vakauqeti (RDPI), veimataqali (Hj ivakatakilakila), vakatabakidua (δj ivakatakilakila) kei na metabolite vakatabakidua (Si ivakatakilakila). Na tubu ena ivakatagedegede ni kena vakatabakidua (δj) e vakaraitaka ni, ena ivakatautauvata, e levu cake na herbivorous vakatabakidua na veika bula ena vakayacori, ni dua na lailai sobu ni veimataqali (Hj) e vakaraitaka na lailai sobu ni kena buli na veika bula se sega ni tautauvata na veiwaseyaki ni veika bula ena mape ni veisoliyaki . Na Si yaga e vakalewa se na metabolite e vakatabakidua ki na dua na ituvaki soli (eke, daukana co) se veibasai ni maroroi ena dua ga na ivakatagedegede. (B) Na iyaloyalo ni vakasama ni veitaqomaki vakasama ni parofisai ena kena vakayagataki na itukutuku ni vakasama axis. Na vakasama ni OD e tukuna ni veivakacacani ni manumanu vuka ena vakalevutaka na veitaqomaki ni veitaqomaki, ka vakalevutaka kina na δj. Ena gauna vata oqori, Hj lailai sobu baleta na itukutuku e vakarautaki tale ki na vakalailaitaki ni sega ni vakadeitaki ni itukutuku ni metabolic. Na vakasama ni MT e tukuna ni veivakacacani ni manumanu vuka ena vakavuna na veisau sega ni veidusimaki ena metabolome, vakalevutaka kina na Hj me vaka e dua na ivakatakilakila ni vakalevutaki ni itukutuku ni metabolic sega ni vakadeitaki ka vakavuna e dua na veiwaseyaki vakaveitalia ni Si. Keitou vakatura talega e dua na ivakaraitaki veiwaki, na MT vinaka duadua, ena so na metabolites kei na cecere ni itataqomaki ni isau ena vakalevutaki vakabibi (cecere Si isau), ni so tale era vakaraitaka na isau ni random (Si lailai isau).
Vakayagataka na ivakamacala ni vakasama ni itukutuku, eda vakadewataka na vakasama ni OD me tukuni kina ni veisau ni metabolite vakatabakidua e vakavuna na herbivore ena dua na ituvaki vakalawa sega ni vakavuna ena vakavuna na (i) e dua na tubu ena ivakatakilakila ni metabolic (Si ivakatakilakila) draivataka na ivakatakilakila ni metabolite (δj ivakatakilakila) Na tubu ni) eso na ilawalawa vakatabakidua ni metabolite kei na cecere ni veitaqomaki ( index) ena vuku ni veisau ni veiwaseyaki ni veigauna ni metabolic ki na levu cake na veiwaseyaki ni yago ni leptin. Ena ivakatagedegede ni dua ga na metabolite, e dua na veiwaseyaki ni Si vakaroti e namaki, na vanua ena vakalevutaka kina na metabolite na isau ni Si me vaka na kena isau ni veitaqomaki (iTaba 1B). Ena laini oqo, eda vakamacalataka na vakasama ni MT me tukuni kina ni veivakauqeti ena vakavuna na (i) veisau sega ni veidusimaki ena metabolites ka vakavuna na kena vakalailaitaki na ivakatakilakila ni δj, kei na (ii) na tubu ena ivakatakilakila ni Hj ena vuku ni kena tubu na sega ni vakadeitaki ni metabolic. Se na veivakaduiduitaki, ka rawa ni vakarautaki ena entropy ni Shannon ena ivakarau ni veimataqali raraba. Me baleta na ituvatuva ni metabolic, na vakasama ni MT ena tukuna na veiwaseyaki ni Si. Ni vakasamataki ni so na metabolites era tiko ena ruku ni ituvaki vakatabakidua ena ruku ni ituvaki vakatabakidua, kei na ituvaki tale eso era sega ni tiko ena ruku ni ituvaki vakatabakidua, kei na nodra itataqomaki yaga e vakatau ena vanua, keitou a vakatura talega e dua na ivakaraitaki ni itataqomaki veiwaki, ena kena δj kei na Hj era veisoliyaki ena rua vata kei na Si Vakalevutaka ena veisala kecega, eso ga na metabolite cecere vakalevutaka na ilawalawa ena, ka sa tiko kina e dua na ilawalawa cecere ni metabolite. veisoliyaki (iTaba 1B).
Me rawa ni vakatovolei kina na parofisai ni vakasama ni veitaqomaki vakavoutaki ena axis ni ivakamacala ni vakasama ni itukutuku, keitou a susuga cake na kenadau (Ms) se na kenadau (Sl) na manumanu lalai ni manumanu vuka ena draunikau ni Nepenthes pallens (iTaba 2A). Vakayagataka na vakadidike ni MS / MS, keitou a rawata na 599 sega ni vakayagataki na MS / MS spectra (faile ni itukutuku S1) mai na methanol ni veitiki ni draunikau era kumuni ni oti na vakani ni manumanu lalai. Vakayagataka na RDPI, Hj, kei na δj ivakatakilakila me raitayaloyalotaka na kena vakavoutaki na itukutuku ni lewena ena faile ni MS / MS vakavoutaki e vakaraitaka na ivakarau taleitaki (iTaba 2B). Na ivakarau raraba sai koya, me vaka e vakamacalataka na ivakamacala ni itukutuku, me vaka ni ra tomana tikoga na manumanu lalai na nodra kania na draunikau, na ivakatagedegede ni veivakavoui kece ni metabolic e tubu ena veigauna: 72 na auwa ni oti na kena kana na herbivore, na RDPI e tubu sara vakalevu. Ni vakatauvatani kei na lewa sega ni vakacacani, Hj a vakalailaitaki sara vakalevu, ka sa baleta na kena vakalevutaki na ivakatagedegede ni kena vakatabakidua na itukutuku ni metabolic, ka sa vakarautaki ena ivakatakilakila ni δj. Na ivakarau e laurai oqo e salavata kei na parofisai ni vakasama ni OD, ia e sega ni salavata kei na parofisai levu ni vakasama ni MT, ka vakabauta ni veisau random (sega ni veidusimaki) ena ivakatagedegede ni metabolite e vakayagataki me vaka e dua na camouflage ni veitaqomaki (iTaba 1B). Dina ga ni duidui na itukutuku ni elicitor ni gusu (OS) kei na itovo ni kana ni rua na herbivores oqo, na nodra kana vakadodonu e vakavuna na veisau tautauvata ena veidusimaki ni Hj kei na δj ena gauna ni tatamusuki ni 24 na auwa kei na 72 na auwa. Na duidui duadua ga e yaco ena 72 na auwa ni RDPI. Ni vakatauvatani kei na kena e vakavuna na Ms vakani, na metabolism raraba e vakavuna na Sl vakani e cecere cake.
(A) Na ituvatuva ni veivakatovolei: na vuaka raraba (S1) se kenadau (Ms) na manumanu vuka era vakani ena draunikau vakasavasavataki ni kau ni pitcher, ni baleta na manumanu vuka vakatautauvatataki, na OS ni Ms (W + OSMs) e vakayagataki me qarava na puncture ni itutu ni draunikau vakatautauvatataki mavoa. S1 (W + OSSl) larvas o agua (W + W). Na kena lewa (C) e dua na draunikau sega ni vakacacani. (B) Na rawa ni vakauqeti (RDPI vakatauvatani kei na ituvatuva ni lewa), veimataqali (Hj ivakatakilakila) kei na kena vakatabakidua (δj ivakatakilakila) ivakatakilakila e vakarautaki me baleta na mape ni metabolite vakatabakidua (599 MS / MS; faile ni itukutuku S1). Na kalokalo e vakaraitaka na duidui levu ena maliwa ni vakani vakadodonu ni herbivore kei na ilawalawa ni lewa (T-vakatovotovo ni gonevuli kei na t-vakatovolei ni veiwatini, * P <0.05 kei na *** P <0.001). ns, sega ni bibi. (C) Na ivakatakilakila ni vakatulewa ni gauna ni levu (kato karakarawa, amino asidi, asidi vakayago kei na suka; faile ni itukutuku S2) kei na spectrum ni metabolite vakatabakidua (kato damudamu 443 MS / MS; faile ni itukutuku S1) ni oti na veiqaravi ni herbivory vakatautauvatataki. Na ilawalawa ni roka e vakaibalebaletaka na 95% na gauna ni vakanuinui. Na kalokalo e vakaraitaka na duidui levu ena maliwa ni veiqaravi kei na kena lewa [vakadidike ni veisau (ANOVA), ka tarava mai na duidui bibi dina nei Tukey (HSD) me baleta na veivakatautauvatataki e vuqa ni post hoc, * P <0.05, ** P <0.01 Kei na *** P <0.001]. (D) Vakatabakidua ni veiwaseyaki ni veitiki kei na itukutuku ni metabolite vakatabakidua (ivakaraitaki vakawasoma kei na veiqaravi duidui).
Me dikevi se na veisautaki ni manumanu vuka ena ivakatagedegede ni metabolome e vakaraitaki ena veisau ni ivakatagedegede ni veivakatorocaketaki yadua, keitou a vakanamata taumada ki na veivakatorocaketaki e vulici taumada ena draunikau ni Nepenthes pallens kei na vakadinadinataki ni veivakacacani ni manumanu vuka. Na amides ni phenolic e veivakaduavatataki ni veivakaduiduitaki ni veivakaduiduitaki ka dau kumuni ena gauna ni veivakaduiduitaki ni manumanu lalai ka kilai me vakalailaitaka na cakacaka ni manumanu lalai (32). Keitou vakasaqara na veivakadeitaki ni MS / MS veiganiti ka droinitaka na nodra curves ni kinetic ni kumuni (iTaba S1). E sega ni kurabuitaki, na veivakabulabulataki ni phenol ka sega ni vakaitavi vakadodonu ena itataqomaki mai na manumanu vuka, me vaka na chlorogenic acid (CGA) kei na rutin, era sa vakalailaitaki sobu ni oti na manumanu vuka. Ena kena veibasai, na manumanu dau kania na co e rawa ni cakava na phenol amides kaukauwa sara. Na kena tomani tikoga na nodrau kana na manumanu vuka e rua e vakavuna me voleka ni tautauvata na kena irairai ni veivakauqeti ni veivakabulabulataki, ka sa matata sara na ivakarau oqo me baleta na de novo ni veivakabulabulataki. Na ka vata ga oqo ena laurai ena gauna e vakadikevi kina na sala ni 17-HGL-DTGs, ka vakavuna e dua na iwiliwili levu ni diterpenes acyclic kei na cakacaka ni veivakabulabulataki ni veivakabulabulataki (33), ni Ms Feeding vata kei na Sl ivakamacala vakatautauvata).
Na leqa e rawa ni yaco ena veivakatovolei ni vakani vakadodonu ni manumanu vuka sai koya na duidui ni iwiliwili ni kena vakayagataki na draunikau kei na gauna ni kana ni manumanu vuka, ka vakadredretaka me vakaotia na veivakacacani ni manumanu vuka-vakatabakidua e vakavuna na mavoa kei na manumanu vuka. Me rawa ni wali vinaka cake na veimataqali herbivore vakatabakidua ni isau ni metabolic ni draunikau vakauqeti, keitou vakatotomuria na vakani ni Ms kei na Sl larvae ena kena vakayagataki sara ga na OS vou e kumuni (OSM kei na OSS1) ki na ivakatagedegede ni puncture W ni itutu ni draunikau tudei. Na iwalewale oqo e vakatokai na W + OS veiqaravi, ka sa vakatautauvatataka na induction ena kena vakadodonutaki na gauna ni itekitekivu ni isau e vakavuna na herbivore ka sega ni vakavuna na veivakayalolailaitaki ni duidui ena ivakarau se levu ni vakayali ni yago (iTaba 2A) (34). Vakayagataka na MS/MS vakadidike kei na paipo ni vakasama, keitou a rawata na 443 MS/MS spectra (faile ni itukutuku S1), ka vakacurumi vata kei na spectra sa soqoni vata mai na veivakatovolei ni kakana vakadodonu. Na vakadidike ni vakasama ni itukutuku ni itukutuku ni MS / MS oqo e vakaraitaka ni kena vakavoutaki na metabolomes ni draunikau-vakatabakidua ena kena vakatotomuri na manumanu vuka e vakaraitaka na veivakauqeti ni OS-vakatabakidua (iTaba 2C). Vakabibi, vakatauvatani kei na veiqaravi ni OSS1, OSM e vakavuna e dua na vakatorocaketaki ni metabolome vakatabakidua ena 4 na auwa. E dodonu me da kila ni vakatauvatani kei na itukutuku ni vakatovotovo ni vakani vakadodonu ni herbivore, na kinetics ni metabolic vakaraitaki ena vanua e rua na kena vakayagataki na Hj kei na δj me vaka na veitaratara kei na veidusimaki ni kenadau ni metabolome ena kena saumi na veiqaravi ni herbivore vakatautauvatataki ena gauna Vakalevutaka na tudei (iTaba 2D). Ena gauna vata oqori, keitou vakarautaka na lewe ni amino asidi, asidi ni bula kei na suka (faile ni itukutuku S2) me vakadikevi kina se na tubu oqo e taketetaki ena kenadau ni metabolome e baleta na kena vakavoutaki na veisautaki ni kaboni ni lomadonu ena kena saumi na veivakatautauvatataki ni herbivores ( itaba S2). Me vakamacalataki vinaka cake na ivakarau oqo, keitou a vakaraica tale na veivakabulabulataki ni veivakabulabulataki ni veivakabulabulataki ni veivakabulabulataki ni veivakabulabulataki kei na 17-HGL-DTG. Na OS-vakatabakidua na kena vakacurumi na manumanu vuka e veisautaki ki na dua na ivakarau ni veisautaki ni duidui ena loma ni veisautaki ni phenolamide (iTaba S3). Na amides ni phenolic e tiko kina na iwasewase ni coumarin kei na caffeoyl e vinaka cake me vakauqeti mai na OSS1, ni OSMs e vakavuna e dua na vakauqeti vakatabakidua ni veivakaduiduitaki ni ferulyl. Me baleta na sala ni 17-HGL-DTG, na veivakaduiduitaki ni OS ni veivakaduiduitaki ena veivakaduiduitaki ni veivakaduiduitaki kei na veivakaduiduitaki ni veivakaduiduitaki (iTaba S3).
Tarava, keitou vulica na OS-vakavuna na palasitika ni volavola ena kena vakayagataki na itukutuku ni gauna-ni vuli microarray, ka vakatotomuria na vakayagataki ni OSMs me qaravi kina na draunikau ni draunikau ni rosette ena manumanu vuka. Na ivakaraitaki ni veivakayarayarataki e vakatau sara ga ena veivakayarayarataki e vakayagataki ena vuli oqo ni veivakabulabulataki (35). Ni vakatauvatani kei na metabolome reconfiguration ena kena sa vakalevutaki vakabibi na palasitika ni metabolic ena veigauna, eda raica na vakacaca ni volavola vakalekaleka ena draunikau e vakavuna na Ms, na vanua e tiko kina na inducibility ni volavola (RDPI) kei na kenadau (δj) ena 1 E a dua na tubu levu ena auwa, kei na duidui (Hj) ena gauna oqo e vakalailaitaki kina na BMPx, na rela1. ni kena vakatabakidua na volavola (iTaba S4). Na matavuvale ni gene ni metabolic (me vaka na P450, glycosyltransferase, kei na BAHD acyltransferase) era vakaitavi ena iwalewale ni kena vakasoqoni vata na veitiki ni yago vakatabakidua mai na iuniti ni ituvatuva e rawati mai na veitiki ni yago taumada, ka muria na ivakaraitaki ni kena sa tukuni oti mai na imatai ni cecere-vakatabakidua. Me vaka e dua na kisi ni vuli, a vakadikevi na sala ni phenilalanine. Na vakadidike e vakadeitaka ni veitiki ni yago ena veisautaki ni phenolamide e cecere sara na OS-vakauqeti ena herbivores ni vakatauvatani kei na veivunikau sega ni taleitaki, ka ra sa veivolekati sara ena nodra ivakarau ni vakaraitaka. Na ka ni volavola MYB8 kei na ituvatuva ni genes PAL1, PAL2, C4H kei na 4CL ena dela ni sala oqo e vakaraitaka na itekitekivu taumada ni volavola. Na veisautaki ni acyl ka vakaitavi ena iotioti ni soqoni ni veivakabulabulataki, me vaka na AT1, DH29, kei na CV86, vakaraitaka e dua na ivakarau ni veivakabulabulataki balavu (iTaba S4). Na veika e laurai e cake e vakaraitaka ni kena tekivutaki taumada na kena vakatovotovotaki na transcriptome kei na kena vakatorocaketaki e muri na kena vakatovotovotaki na metabolomics e dua na ivakarau ni veiwatini, ka rawa ni baleta na ivakarau ni veivakalawataki ni synchronous ka tekivuna e dua na isau ni veitaqomaki kaukauwa.
Na kena vakavoutaki ena ivakatakilakila ni homoni ni kau e cakacaka me vaka e dua na ituvatuva ni lawatu ka vakaduavatataka na itukutuku ni herbivorous me vakavoutaki tale na physiology ni kau. Ni oti na vakatovotovo ni manumanu vuka, keitou vakarautaka na dinamika ni kumuni ni veimataqali homoni ni kau bibi ka raica na vakasama ni veimaliwai vakayago ena kedrau maliwa [Pearson veiwekani ni veiwekani (PCC)> 0.4] (iTaba 3A). Me vaka e namaki, na homoni ni kau e semati ki na biosynthesis e semati ena loma ni rede ni co-vakaraitaki ni homoni ni kau. Me kena ikuri, na metabolic vakatabakidua (Si ivakatakilakila) e mapetaki ki na rede oqo me vakaraitaka na homoni ni kau e vakavuna na veiqaravi duidui. E rua na vanua lelevu ni isau vakatabakidua ni herbivorous e droinitaki: e dua e tiko ena ilawalawa ni JA, na vanua e vakaraitaka kina na JA (kena fomu ni bulabula JA-Ile) kei na so tale na JA e vakatubura na sikoa cecere duadua ni Si; na kena kadua na etileni (ET). E vakaraitaka ga na Gibberellin e dua na tubu vakalailai ena kena vakayagataki na manumanu somidi, ia eso tale na homoni ni kau, me vaka na cytokinin, auxin, kei na abscisic acid, e lailai na kena vakayagataki na manumanu somidi. Ni vakatauvatani kei na kena vakayagataki na W + W duadua ga, na kena vakalevutaki na isau ni cecere ni JA na veivakatorocaketaki ena OS ni kerekere (W + OS) e rawa ni veisautaki vakatabakidua ki na dua na ivakatakilakila kaukauwa ni JAs. E sega ni namaki, OSM kei na OSS1 kei na duidui ni elicitor na lewena e kilai me vakavuna na tautauvata ni vakasoqoni vata ni JA kei na JA-Ile. Ena kena veibasai kei na OSS1, OSM e vakatabakidua ka kaukauwa na kena vakauqeti na OSMs, ni OSS1 e sega ni vakalevutaka na isau ni mavoa basal (iTaba 3B).
(A) Co-vakamacalataka na rede ni vakadidike e yavutaki ena PCC na iwiliwili ni herbivore-vakavuna na kau ni homoni ni vakasoqoni vata ni veivakatautauvatataki. Na node e vakaraitaka e dua na homoni ni kau, kei na levu ni node e vakaraitaka na Si index vakatabakidua ki na homoni ni kau ena maliwa ni veiqaravi. (B) Na vakasoqoni vata ni JA, JA-Ile kei na ET ena draunikau e vakavuna na veiqaravi duidui e vakaraitaki ena veimataqali roka: aprikoti, W + OSM; karakarawa, W + OSSl; karakarawa, W + W; vulavula, C (lewa) . Na kalokalo e vakaraitaka na duidui levu ena maliwa ni veiqaravi kei na lewa (rua na sala ANOVA ka tarava mai na Tukey HSD ni oti na hoc veivakatautauvatataki e vuqa, *** P <0.001). Na vakadidike ni vakasama ni itukutuku ni (C) 697 MS / MS (faile ni itukutuku S1) ena JA biosynthesis kei na vakaleqai ni rai ni vakasama (irAOC kei na irCOI1) kei na (D) 585 MS / MS (faile ni itukutuku S1) ena ETR1 kei na vakaleqai ni sikinala ni ET E rua na ituvatuva ni veiqaravi ni lewa ni herbivore vakatautauvatataki kei na ituvatuva ni vecle emp vakavuna. Na kalokalo e vakaraitaka na duidui levu ena maliwa ni W + OS veiqaravi kei na lewa sega ni vakacacani (rua na sala ANOVA ka tarava mai na Tukey HSD ni oti na hoc veivakatautauvatataki e vuqa, * P <0.05, ** P <0.01 kei na *** P <0.001). (E) Na kalavo veiwaseyaki ni veivakacacani veiwaseyaki ki na kena vakatabakidua. Na roka e vakaraitaka na veimataqali manumanu duidui e veisautaki vakayago; na ivakatakilakila e vakaraitaka na iwalewale ni veiqaravi duidui: matatolu, W + OSS1; vakababa, W + OSM; vakavolivolita C
Tarava, eda vakayagataka e dua na mataqali veisautaki ni Nepenthes vakalailaitaki (irCOI1 kei na sETR1) ena ikalawa bibi ni JA kei na ET biosynthesis (irAOC kei na irACO) kei na rai (irCOI1 kei na sETR1) me dikevi kina na veisautaki ni rua na kau oqo ena cau ni herbivores Na veiwekani. Me salavata kei na veivakatovolei sa oti, keitou vakadeitaka na kena vakacurumi na herbivore-OS ena veikau ni kauta lala (EV) (iTaba 3, C ki na D) kei na kena vakalailaitaki raraba na ivakatakilakila ni Hj e vakavuna na OSM, ni sa tubu cake na ivakatakilakila ni δj. Na kena isau e vakaraitaki vakalevu cake mai na kena isau e vakavuna na OSS1. E dua na kalavo ni rua na laini e vakayagataka na Hj kei na δj me vaka na veitaratara e vakaraitaka na deregulation vakatabakidua (iTaba 3E). Na ivakarau matata duadua sai koya ena veimataqali sega na sikinala ni JA, na veimataqali metabolome kei na veisau ni kena vakatabakidua e vakavuna na manumanu daukana co sa voleka ni vakaoti vakadua (iTaba 3C). Ena kena veibasai, na vakasama ni ET vakanomodi ena sETR1 na veivunikau, e dina ga ni kena revurevu raraba ena veisau ena veisau ni kakana draudrau e lailai sara mai na kena ni JA vakatakilakila, e vakalailaitaka na duidui ena Hj kei na δj indices ena maliwa ni OSM kei na OSS1 veivakauqeti (iTaba 3D kei na itaba S5). . Oqo e vakaraitaka ni ikuri ni cakacaka bibi ni JA sikinala ni veisau, ET sikinala ni veisau e veiqaravi talega me vaka e dua na vakavinakataki ni veimataqali-vakatabakidua na isau ni metabolic ni herbivores. Me salavata kei na cakacaka vinaka oqo, e sega ni dua na veisau ena kena rawati na metabolome raraba ena veivunikau sETR1. Ena yasana kadua, vakatauvatani kei na sETR1 na kau, na kau ni irACO e vakavuna na veisau raraba tautauvata ni veisau ni metabolic e vakavuna na manumanu vuka, ia e vakaraitaka na duidui levu ni Hj kei na δj na sikoa ena maliwa ni OSM kei na OSS1 na veibolebole (iTaba S5).
Me rawa ni kilai na metabolites vakatabakidua e tiko kina na cau bibi ki na isau ni veimataqali-vakatabakidua ni herbivores ka vakavinakataka na nodra buli ena sikinala ni ET, keitou vakayagataka na iwalewale ni MS / MS ni ituvatuva sa vakarautaki oti. Na iwalewale oqo e vakararavi ki na iwalewale ni bi-vakasoqoni vata me vakadeitaka tale na matavuvale ni metabolic mai na MS / MS na tikitiki [vakatautauvatataki na dot ni ivoli (NDP)] kei na sikoa tautauvata e yavutaki ena lusi ni tawaveitovaki (NL). Na itukutuku ni MS / MS e tara ena kena vakadikevi na laini ni transgenic ni ET e vakavuna na 585 MS / MS (faile ni itukutuku S1), ka a wali ena kena vakasoqoni ira vata ki na vitu na MS / MS levu (M) (itaba 4A) . Eso vei ira na modules oqo era sa densely vakasinaiti ena metabolites vakatabakidua sa vakatakilakilataki oti: me kena ivakaraitaki, M1, M2, M3, M4 kei na M7 era vutuniyau ena veimataqali phenol derivatives (M1), flavonoid glycosides (M2), acyl suka (M3 Kei na M4), kei na 17-HGL-DTG (M7). Me kena ikuri, na itukutuku vakatabakidua ni metabolic (Si ivakatakilakila) ni dua ga na metabolite ena veitiki yadua e vakarautaki, kei na kena veiwaseyaki ni Si e rawa ni laurai vakavinaka. Me vakalekalekataki, na MS / MS spectra vakaraitaka na cecere ni herbivory kei na genotype vakatabakidua e vakatakilakilataki ena cecere ni Si na kena yaga, kei na iwiliwili ni kurtosis e vakaraitaka na veiwasei ni vuti ni manumanu ena tutu ni iqaqalo imatau. E dua na veiwaseyaki ni colloid vakaoqo e laurai ena M1, ena kena vakaraitaka na amide ni phenol na iwasewase cecere duadua ni Si (itaba 4B). Na 17-HGL-DTG ena M7 e vakaraitaka e dua na sikoa ni Si vakatautauvata, ka vakaraitaka e dua na ivakatagedegede ni veivakaduiduitaki ni lawatu ena maliwa ni rua na mataqali OS. Ena kena veibasai, e levu duadua na veivakaduiduitaki vakatabakidua e buli, me vaka na rutin, CGA, kei na suka ni acyl, era maliwai ira na sikoa lailai duadua ni Si. Me rawa ni dikevi vinaka cake na veivakatorocaketaki ni veivakatorocaketaki kei na Si veiwaseyaki ena maliwa ni metabolites vakatabakidua, e dua na rede ni molecule a tara me baleta na module yadua (iTaba 4B). E dua na parofisai bibi ni vakasama ni OD (vakalekalekataki ena itaba 1B) sai koya na kena tuvanaki tale na metabolites vakatabakidua ni oti na herbivory e dodonu me vakavuna na veisau ni dua na sala ena metabolites kei na isau ni veitaqomaki cecere, vakabibi ena kena vakalevutaki na nodra vakatabakidua (me vaka na kena veibasai kei na veisoliyaki vakaveitalia) ivakarau) Na metabolite ni veitaqomaki e parofisaitaki mai na vakasama ni MT. E vuqa na veivakabulabulataki ni phenol e kumuni ena M1 era cakacaka vata kei na lutu ni cakacaka ni manumanu lalai (32). Ni vakatautauvatataki na Si na isau ena M1 veisau ena maliwa ni draunikau vakauqeti kei na draunikau vakaitamera ni EV lewa na veivunikau ena 24 na auwa, keitou raica ni veisautaki ni metabolic ni vuqa na veisautaki ni oti na manumanu lalai herbivory e dua na ivakarau ni tubu levu (iTaba 4C). Na tubu vakatabakidua ni Si yaga e laurai ga ena phenolamides ni veitaqomaki, ia e sega ni dua na tubu ni Si yaga e laurai ena so tale na phenols kei na veisau sega ni kilai era tiko vata ena module oqo. Oqo e dua na ivakaraitaki vakatabakidua, ka sa veiwekani kei na vakasama ni OD. Na veivakasama levu ni veisau ni metabolic e vakavuna na manumanu dau kana co e tudei. Me rawa ni vakatovolei se na kena vakatabakidua oqo ni ivakarau ni phenolamide a vakavuna na OS-vakatabakidua na ET, keitou a droinitaka na ivakatakilakila ni metabolite Si ka vakavuna e dua na duidui ni vakaraitaki ni yaga ena maliwa ni OSM kei na OSS1 ena EV kei na sETR1 genotypes (iTaba 4D ). Ena sETR1, na duidui e vakavuna na phenamide ena maliwa ni OSM kei na OSS1 e vakalailaitaki sara vakalevu. Na iwalewale ni bi-vakasoqoni vata a vakayagataki talega ki na itukutuku ni MS / MS e kumuni ena veimataqali kei na sega ni rauta na JA me vakadeitaka na modules levu ni MS / MS e semati ki na JA-vakalawataki na kenadau ni metabolic (iTaba S6).
(A) Na veivakasoqoni vata ni 585 MS / MS yavutaki ena wasei ni tikitiki (NDP tautauvata) kei na wasei ni vakayali ni tawaveitovaki (NL tautauvata) na kena isau ena module (M) me veiganiti kei na matavuvale ni veivakaduavatataki kilai, se ena sega ni kilai se sega ni vinaka na kena vakayagataki na Metabolite ni veivakaduavatataki. Ena yasa ni veitiki yadua, na veiwaseyaki ni veisau (MS/MS) vakatabakidua (Si) e vakaraitaki. (B) Rede ni molecule ni modular: Na nodes e matataka na MS / MS kei na kena icavacava, NDP (damudamu) kei na NL (karakarawa) MS / MS na sikoa (musuki-off,> 0.6). Na ivakatakilakila ni metabolite vakarautaki (Si) rokataki yavutaki ena module (imawi) ka mapetaki ki na rede ni molecule (matau). (C) Na iwasewase M1 ni EV na kau ena ituvatuva (lewa) kei na ituvaki ni veivakauqeti (vakatautauvatataki na manumanu) ena 24 na auwa: iyaloyalo ni rede ni molecule (Si yaga na levu ni node, phenolamide ni veitaqomaki e vakaraitaki ena karakarawa). (D) Na M1 iyaloyalo ni rede ni molecule ni laini ni spectrum sETR1 kei na vakaleqai ni EV kei na ET na rai: na phenolic na veivakaduavatataki e vakaraitaki ena node ni maliwa lala drokadroka, kei na duidui bibi (P yaga) ena maliwa ni W + OSM kei na W + OSS1 veiqaravi me vaka na levu ni Node. CP, N-kafeoili-tairosini; CS, N-kafeoil-vakacacani; FP, N-asidi ni asidi ni asidi-uriki; FS, N-ferulili-vakabulabulataki; CoP, N', N "-Cumarolil-tirosina; DCS, N', N"-Dicafeoil-Espermidina; CFS, N', N"-cafeoil, feruloyl-espermidina;
Keitou vakarabailevutaka tale na vakadidike mai na dua ga na genotype ni Nepenthes vakalailaitaki ki na iwiliwili ni tamata, na vanua e sa vakamacalataki oti kina na veisau kaukauwa ni intraspecific ena ivakatagedegede ni JA ni manumanu kei na ivakatagedegede ni metabolite vakatabakidua ena iwiliwili ni tamata (26). Vakayagataka na itukutuku oqo me ubia na 43 na manumanu somidi. Na manumanu somidi oqo e tiko kina e 123 na mataqali kau mai na N. pallens. Na veivunikau oqo era a tauri mai na sorenikau era kumuni ena veivanua duidui ni vanua dina e Utah, Nevada, Arizona, kei Kalifonia (iTaba S7), keitou vakarautaka na veimataqali metabolome (e vakatokai eke na ivakatagedegede ni iwiliwili ni tamata) β veimataqali) kei na kena vakatabakidua e vakavuna na OSM. Me salavata kei na vakadidike sa oti, keitou raica e dua na veisau raraba ni veisau ena Hj kei na δj axes, ka vakaraitaka ni germplasms e tiko na duidui levu ena palasitika ni nodra isau ni veisau ki na manumanu vuka (iTaba S7). Na isoqosoqo oqo e vakananuma lesu na veika e laurai taumada me baleta na veisau dina ni JAs e vakavuna na manumanu vuka, ka sa maroroya tiko e dua na isau cecere sara ena dua ga na iwiliwili (26, 36). Ena kena vakayagataki na JA kei na JA-Ile me vakatovolei kina na veiwekani raraba ni ivakatagedegede ena maliwa ni Hj kei na δj, keitou kunea ni tiko e dua na veiwekani vinaka bibi ena maliwa ni JA kei na metabolome β veimataqali kei na ivakatakilakila ni kenadau (iTaba S7). Oqo e vakaraitaka ni veivakaduiduitaki ni veivakaduiduitaki ni veivakaduiduitaki ni veivakaduiduitaki ena JAs e kunei ena ivakatagedegede ni iwiliwili ni tamata e rawa ni baleta na veivakaduiduitaki bibi ni metabolic e vakavuna na digidigi mai na veivakaduiduitaki ni veivakaduiduitaki ni manumanu lalai.
Na vakadidike sa oti e vakaraitaka ni mataqali tavako e duidui sara vakalevu ena mataqali kei na veiwekani ni vakararavi ena itataqomaki ni metabolic vakauqeti kei na veivakatorocaketaki. E vakabauti ni veisau oqo ena veisautaki ni sikinala ni anti-herbivore kei na rawaka ni veitaqomaki e vakalawataki ena veivakasaurarataki ni iwiliwili ni manumanu lalai, bula ni kau, kei na isau ni buli ni veitaqomaki ena niche e tubu kina e dua na mataqali soli. Keitou vulica na kena tudei na veisautaki ni draunikau e vakavuna na manumanu vuka ni ono na mataqali Nicotiana era vakaitikotiko ena Vualiku kei Amerika kei na Ceva kei Amerika. Na mataqali manumanu oqo era veiwekani voleka sara kei na Nepenthes Vualiku kei Amerika, yacana o Nicolas Bociflo. La, N. nikotini, Nicotiana n. na co vakamalumalumutaki, na tavako, na tavako linear, na tavako kei na tavako ni drau ni tavako (iTaba 5A) (37). E ono vei ira na mataqali oqo, oka kina na mataqali N. yalovinaka, era kau vakayabaki ni ilawalawa ni petunia, kei na obtusifolia N. era kau vakayabaki ni ilawalawa ganedra Trigonophyllae (38). E muri, W + W, W + OSM kei na W + OSS1 induction a vakayacori ena vitu na mataqali oqo me vulici kina na veimataqali-ivakatagedegede ni metabolic ni veivakabulabulataki ni manumanu lalai.
(A) E dua na vunikau ni phylogenetic ni bootstrap e yavutaki ena kena rawa ni levu duadua [me baleta na veivakatorocaketaki ni glutamine ni niukilia (38)] kei na veiwasei ni vanua ni vitu na mataqali Nicotiana veivolekati (roka duidui) (37). (B) E dua na ituvatuva ni veibiuyaki ni veimataqali vakatabakidua me baleta na itukutuku ni veisautaki ni vitu na mataqali Nicotiana (939 MS / MS; faile ni itukutuku S1). Ena ivakatagedegede ni veimataqali, na veimataqali metabolome e sega ni vinaka na kena veiwekani kei na ivakatagedegede ni kena vakatabakidua. Na vakadidike ni veiwekani ni veimataqali-ivakatagedegede ena maliwa ni veimataqali metabolic kei na kena vakatabakidua kei na JA vakasoqoni vata e vakaraitaki ena itaba 2. S9. Roka, duidui na mataqali; tolu na yasana, W + OSS1; vakababa, W + OSM; (C) Nicotiana JA kei na JA-Ile dinamika e vakarautaki me vaka na OS veivakauqeti amplitude (rua na sala ANOVA kei na Tukey HSD ni oti na veivakatautauvatataki e vuqa, * P <0.05, ** P <0.01 kei na * ** Me baleta na veivakatautauvatataki ni W + OS kei na W + W, P <0.001). Kato ni droini ni (D) veimataqali kei na (E) vakatabakidua ni veimataqali yadua ni oti na kena vakatotomuri na manumanu vuka kei na methyl JA (MeJA). Na kalokalo e vakaraitaka na duidui levu ena maliwa ni W + OS kei na W + W se lanolin vata kei na W (Lan + W) se Lan vata kei na MeJA (Lan + MeJa) kei na Lan lewa (rua na sala ni vakadidike ni veisau, ka tarava mai na Tukey ni HSD ni oti na hoc veivakatautauvatataki e vuqa , * P <0.05, ** P <0.01 kei na).
Vakayagataka na iwalewale ni ilawalawa rua, keitou sa vakaraitaka na 9 na module ni 939 MS/MS (faile ni itukutuku S1). Na ituvatuva ni MS/MS vakavoutaki ena veiqaravi duidui e duidui sara vakalevu ena maliwa ni veimataqali modules ena maliwa ni veimataqali (iTaba S8). Na vakasamataki ni Hj (vakatokai eke me vaka na veimataqali-ivakatagedegede γ-veimataqali) kei na δj e vakaraitaka ni veimataqali duidui aggregate ki na ilawalawa duidui sara ena vanua ni metabolic, na vanua e dau vakaraitaki kina na veimataqali-ivakatagedegede ni veiwasei mai na veivakauqeti. Ena kena vakavo ga na N. laini kei na N. obliquus, era vakaraitaka e dua na rabailevu ni dinamika ni veivakauqeti ni veivakauqeti (itaba 5B). Ena kena veibasai, na veimataqali me vaka na N. purpurea kei na N. obtusifolia e dua na isau ni metabolic lailai matata ki na veiqaravi, ia na metabolome e duidui cake. Na veiwaseyaki ni veimataqali-vakatabakidua ni isau ni metabolic vakauqeti e vakavuna e dua na veiwekani ca bibi ena maliwa ni kena vakatabakidua kei na veimataqali gamma (PCC = -0.46, P = 4.9 × 10-8). Na veisau ni OS-vakavuna ena ivakatagedegede ni JAs e veiwekani vinaka kei na metabolome vakatabakidua, ka veiwekani ca kei na veimataqali gamma ni metabolic e vakaraitaka na veimataqali yadua (itaba 5B kei na itaba S9). E dodonu me da kila ni veimataqali colloquially vakatokai me “vakasama ni sikinala” veimataqali ena itaba 5C, me vaka na Nepeni nematodes, Nepeni, Nepeni kaukauwa, kei na Nepeni vakalailaitaki, vakavuna na ivakatakilakila bibi ena 30 na miniti. Na OS-vakatabakidua na JA kei na JA-Ile e se qai yaco walega oqo, ni so tale na manumanu somidi e vakatokai me “ivakatakilakila sega ni sauma”, me vaka na misini ni Nepenthes, Nepenthes pauta kei na N. Ena ivakatagedegede ni metabolic, me vaka e sa tukuni oti mai cake, me baleta na Nepenthes vakalailaitaki, na veika e sauma na sikinala e vakaraitaka na OS vakatabakidua ka vakalevutaka sara vakalevu na δj, ni vakalailaitaka na Hj. Na OS-vakatabakidua na priming na kena revurevu oqo e sega ni laurai ena veimataqali vakatokai me sikinala sega ni veisautaki na veimataqali (itaba 5, D kei na E). OS-vakatabakidua na metabolites e wasei vakalevu cake ena maliwa ni veimataqali sikinala-vakasama, kei na ilawalawa ni sikinala oqo era soqoni vata kei na veimataqali kei na malumalumu ni sikinala ni isau, ni veimataqali kei na malumalumu ni sikinala ni isau e vakaraitaka lailai na veivakararavi (iTaba S8 ). Na macala oqo e vakaraitaka ni OS-vakatabakidua na kena vakacurumi na JAs kei na OS-vakatabakidua na kena vakavoutaki na metabolome ni sobu era sa veiwekani ena ivakatagedegede ni veimataqali.
Tarava, keitou vakayagataka e dua na lanolin vakalivaliva e tiko kina na methyl JA (MeJA) me qaravi kina na veivunikau me vakadikevi kina kevaka e vakatabui na ivakarau ni veimaliwai oqo ena kena rawati na JA e vakayagataki mai na JA exogenous, ka na tiko ena cytoplasm ni veivunikau. Na vakarusai totolo ni JA. Keitou kunea na ivakarau vata ga ni veisau vakamalua mai na veimataqali sikinala-vakasama ki na veimataqali sikinala-sega ni vakasuka e vakavuna na kena tomani tikoga na kena vakarautaki na JA (iTaba 5, D kei na E). Me vakalekalekataki, na veiqaravi ni MeJA e vakavotukanataka tale vakaukauwa na metabolomes ni manumanu lalai ni laini, N. obliquus, N. wai, N. N. purpurea e vakaraitaka ga e dua na tubu ena δj, ia e sega ni Hj. N. obtusifolia, ka sa vakaraitaki oti me kumuna na ivakatagedegede lailai sara ni JAs, e sauma talega vakaca na veiqaravi ni MeJA ena kena vakavoutaki na metabolome. Na veika oqo e vakaraitaka ni JA na buli se na sikinala ni veisautaki e vakatabui vakayago ena veimataqali sikinala-sega ni saumi. Me vakatovolei na vakasama oqo, keitou vulica na va na mataqali (N. pallens, N. moli, N. roka kei na N. microphylla) vakavuna na W + W, W + OSMs kei na W + OSS1 volavola (39). Me salavata kei na ivakarau ni veisautaki ni metabolome, na veimataqali era sa wasei vinaka ena vanua ni volavola, ena kedra maliwa na N. vakalailaitaki e vakaraitaka na RDPI cecere duadua ni OS-vakauqeti, ni N. gracilis e lailai duadua (iTaba 6A). Ia, e kunei ni veimataqali volavola e vakavuna na N. oblonga e lailai duadua ena kedra maliwa na va na mataqali, veibasai kei na veimataqali metabonomic cecere duadua ni N. oblonga e vakaraitaki taumada ena vitu na mataqali. Na vakadidike sa oti e vakaraitaka ni dua na ilawalawa ni genes e baleta na sikinala ni veitaqomaki taumada, oka kina na sikinala ni JA, e vakamacalataka na kena matailalai na isau ni veitaqomaki taumada e vakavuna na elicitors ni herbivore-veiwekani ena veimataqali Nicotiana (39). Na kena vakatautauvatataki na sala ni sikinala ni JA ena maliwa ni va na mataqali oqo e vakaraitaka e dua na ivakarau taleitaki (iTaba 6B). E levu na genes ena sala oqo, me vaka na AOC, OPR3, ACX kei na COI1, e vakaraitaka na ivakatagedegede cecere ni kena vakacurumi ena va na mataqali oqo. Ia, e dua na gene bibi, JAR4, e veisautaka na JA ki na kena ivakarau ni bula ni JA-Ile vakasoqoni vata na volavola, kei na kena ivakatagedegede ni volavola e lailai sara, vakabibi ena N. Me kena ikuri, na volavola ga ni dua tale na gene AOS e sega ni kunei ena N. bifidum. Na veisau oqo ena vakaraitaki ni gene e rawa ni vakavuna na veivakacacani vakaitamera e vakavuna na lailai ni JA ni buli ena veimataqali anergic ni sikinala kei na kena vakacurumi na N. gracilis.
(A) Na vakadidike ni vakasama ni itukutuku ni kena vakavoutaki tale na isau ni volavola taumada ni va na mataqali tavako voleka sara e vakatovotovotaki ni oti e 30 na miniti na kena vakacurumi na herbivory. RDPI e vakarautaki ena kena vakatautauvatataki na draunikau e vakavuna na OS ni herbivore kei na kena lewai na mavoa. Na roka e vakaraitaka na veimataqali manumanu, kei na ivakatakilakila e vakaraitaka na iwalewale ni veiqaravi duidui. (B) Vakadikevi ni vakaraitaki ni gene ena sala ni sikinala ni JA ena maliwa ni va na mataqali. Na sala ni JA vakarawarawataki e vakaraitaki ena yasa ni kato ni droini. Na duidui ni roka e vakaraitaka na duidui ni iwalewale ni kena vakayacori. Na kalokalo e vakaraitaka ni tiko e dua na duidui levu ena maliwa ni W + OS veiqaravi kei na W + W lewa (me baleta na t-vakatovotovo ni gonevuli me baleta na duidui ni veiwatini, * P <0.05, ** P <0.01 kei na *** P <0.001). OPDA, 12-asidi ni vakasaqa; OPC-8: 0,3-oxo-2 (2'(Z)-pentinili)-saikolopentini-1-okitanoiki asidi.
Ena iotioti ni iwase, keitou vulica na sala e rawa ni vorata kina na manumanu lalai na veimataqali manumanu lalai-vakatabakidua na metabolome ni veimataqali kau duidui. Na vakadidike sa oti e vakabibitaka na mataqali Nicotiana. Na nodra vorata na Ms kei na larvae e duidui sara vakalevu (40). Eke, keitou vulica na veiwekani ena maliwa ni ivakaraitaki oqo kei na nodra palasitika ni metabolic. Vakayagataka na va na mataqali tavako e cake, kei na vakatovotovotaki ni veiwekani ena maliwa ni veimataqali kei na kenadau ni metabolome e vakavuna na herbivores kei na veitusaqati ni kau ki na Ms kei na Sl, keitou kunea na veitusaqati, duidui kei na kenadau ki na generalist Sl Na veika kece era veiwekani vinaka, ni veiwekani bibi na veimataqali e sega ni kei na Fig S10). Me baleta na S1 veivala, ruarua na vakalailaitaki N. chinensis kei na N. gracilis, ka a vakaraitaki taumada me vakaraitaka ruarua na ivakatagedegede ni veisautaki ni sikinala ni JA kei na palasitika ni metabolome, e duidui sara na kena isau ki na veivala ni herbivore, ka rau vakaraitaka talega na veivala cecere tautauvata. Veiyacovi.
Ena onosagavulu na yabaki sa oti, na vakasama ni veitaqomaki ni kau sa vakarautaka e dua na ituvatuva ni vakasama, yavutaki ena kena era sa parofisaitaka na dauvakadidike e dua na iwiliwili levu ni veisau kei na cakacaka ni metabolites vakatabakidua ni kau. E vuqa vei ira na vakasama oqo era sega ni muria na ivakarau tudei ni veivakadeitaki kaukauwa (41). Era vakatura na parofisai bibi (3) ena ivakatagedegede vata ga ni vakadidike. Ni sa vakatovolei na parofisai bibi e rawa kina na vakasama vakatabakidua me vakadikevi, oqo ena cakava na Na vanua e toso tiko ki liu. Mo tokoni, ia mo cakitaki ira na tani (42). Ia, na vakasama vou e cakava na parofisai ena veimataqali ivakatagedegede ni vakadidike ka kuria e dua na itutu vou ni vakasama vakamacala (42). Ia, na rua na vakasama e vakaturi ena ivakatagedegede ni cakacaka, MT kei na OD, e rawarawa sara me vakamacalataki me vaka na parofisai bibi ni veisau ni metabolic vakatabakidua e vakavuna na herbivores: OD vakasama e vakabauta ni veisau ena metabolic vakatabakidua “vanua” e cecere sara na veidusimaki . Na vakasama ni MT e vakabauta ni veisau oqo ena sega ni veidusimaki ka vakaveitalia ena vanua ni metabolic, ka dau tiko kina na metabolites ni veitaqomaki cecere. Na veivakatovolei sa oti ni OD kei na MT na parofisai sa vakatovolei ena kena vakayagataki e dua na ilawalawa lailai ni dua na priori “itataqomaki” na veivakaduavatataki. Na veivakatovolei oqo ni metabolite-centric e tarova na kena rawa ni dikevi na levu kei na sala ni kena vakavoutaki na metabolome ena gauna ni herbivory, ka sega ni vakatara na veivakatovolei ena loma ni dua na ituvatuva ni iwiliwili tudei me gadrevi kina na parofisai bibi ka rawa ni vakasamataki me vaka e dua na taucoko Vakalevutaka na veisau ena metabolome ni kau. Eke, keitou vakayagataka na tekinolaji vou ena metabolomics yavutaki ena MS ni vakasama ka vakayacora na vakadidike ni MS ni deconvolution ena ilavo raraba ni itukutuku ni vakasama ni vakamacala me vakatovolei kina na duidui ena maliwa ni rua e vakaturi ena ivakatagedegede ni metabolomics ni vuravura raraba. Na parofisai bibi ni vakasama oqo. Na vakasama ni itukutuku sa vakayagataki ena vuqa na vanua, vakabibi ena ituvatuva ni veika bula kei na vakadidike ni drodro ni kakana (43). Ia, me vaka eda kila, oqo na imatai ni kerekere e vakayagataki me vakamacalataka na vanua ni itukutuku ni metabolic ni veivunikau ka walia na leqa ni bula e semati ki na veisau ni metabolic vakalekaleka ena kena saumi na cues ni vanua. Vakabibi, na rawa ni iwalewale oqo e tiko ena kena rawa ni veidutaitaka na ivakarau ena loma kei na maliwa ni veimataqali kau me dikevi kina na sala era sa veisau kina na herbivores mai na veimataqali duidui ki na veimataqali macroevolutionary ivakarau ena veimataqali ivakatagedegede ni veisau. Veisau ni yago.
Na vakadidike ni iwasewase bibi (PCA) e veisautaka e dua na itukutuku ni veimataqali ki na dua na vanua ni vakalailaitaki ni veimama me rawa ni vakamacalataki kina na ivakarau levu ni itukutuku, sa dau vakayagataki kina me vaka e dua na iwalewale ni vakadidike me vakadikevi kina na itukutuku, me vaka na metabolome ni deconvolution. Ia, na vakalailaitaki ni veimama ena vakayalia e dua na tiki ni itukutuku e tiko ena itukutuku, ka sega ni rawa ni vakarautaka na PCA na itukutuku vakailavo me baleta na itovo e veiganiti sara ga kei na vakasama ni bula, me vaka: na sala era dau vakavoutaka kina na herbivores na veimataqali ena vanua vakatabakidua (me kena ivakaraitaki, vutuniyau, veisoliyaki) Kei na levu) metabolites? Na veisau cava era dau vakaraitaka na ituvaki ni veivakauqeti ni dua na manumanu dau kania na co? Mai na rai ni kena vakatabakidua, duidui kei na inducibility, na itukutuku ni lewe ni itukutuku ni metabolite ni draunikau-vakatabakidua e vakacacani, ka kunei ni kena laukana na herbivores e rawa ni vakayacora na metabolism vakatabakidua. E sega ni namaki, keitou raica ni, me vaka e vakamacalataki ena ivakatakilakila ni itukutuku ni vakasama e vakayacori, na ituvaki ni metabolic e rawati e tiko kina e dua na veivakacacani levu ni oti na veivakacacani ni rua na herbivores (na bogi-vakani generalist Sl) kei na kenadau ni Solanaceae Ms. E dina ga ni nodra itovo ni kana kei na vakasama e duidui sara vakalevu. Na ivakatekivu ni asidi ni uro-asidi ni amino (FAC) ena OS (31). Ena kena vakayagataki na OS ni manumanu me qaravi kina na mavoa ni puncture vakatautauvatataki, na veiqaravi ni manumanu vakatautauvatataki e vakaraitaka talega e dua na ivakarau vata ga. Na iwalewale vakatautauvatataki oqo me baleta na simulating na isau ni kau ki na veivakacacani ni herbivore e vakaotia na veika veivakayalolailaitaki e vakavuna na veisau ni itovo ni kana ni herbivore, ka vakavuna na duidui ni ivakatagedegede ni vakacaca ena veigauna duidui (34). FAC, ka kilai ni sa vu levu ni OSM, vakalailaitaka na JAS kei na so tale na isau ni hormone ni kau ena OSS1, ni OSS1 vakalailaitaka e drau na gauna (31). Ia, OSS1 vakavuna na ivakatagedegede tautauvata ni JA vakasoqoni vata ni vakatauvatani kei na OSM. Sa vakaraitaki oti ni saumi ni JA ena Nepenthes vakamalumalumutaki e vakaitamera sara na OSM, na vanua e rawa ni maroroya kina na FAC na kena cakacaka kevaka mada ga e vakawaicalataki 1:1000 ena wai (44). O koya gona, ni vakatauvatani kei na OSM, e dina ga ni sa lailai sara na FAC ena OSS1, e sa rauta me vakavuna na kena rauta na JA ni mate. Na vakadidike sa oti e vakaraitaka ni porin-me vaka na protein (45) kei na oligosaccharides (46) e rawa ni vakayagataki me vaka na ivakatakilakila ni molecule me vakavuna na isau ni veitaqomaki ni kau ena OSS1. Ia, e se bera tikoga ni matata se o ira na elicitors oqo ena OSS1 era sa vakavuna na kena kumuni na JA e laurai ena vuli ena gauna oqo.
E dina ga ni vica ga na vakadidike e vakamacalataka na duidui ni iqaqalo ni liga ni metabolic e vakavuna na kena vakayagataki na veimataqali herbivore se exogenous JA se SA (salicylic acid) (47), e sega ni dua e vakaleqa na veimataqali herbivore-vakatabakidua na vakaleqai ena rede ni co ni kau kei na kena revurevu ena ivakarau ni metabolim vakatabakidua Na vakadidike raraba e. itukutuku ni tamata yadua. Na vakadidike oqo e vakadeitaka tale ni veiwekani ni rede ni homoni e loma kei na so tale na homoni ni kau ka sega ni JAs e bulia na kena matailalai ni kena vakavoutaki na metabolic e vakavuna na manumanu daukana. Vakabibi, keitou raica ni ET e vakavuna na OSM e levu cake sara mai na kena e vakavuna na OSS1. Na ivakarau oqo e salavata kei na levu cake na FAC na lewena ena OSM, ka sa dua na ituvaki e gadrevi ka rauta me baleta na kena vakavuna e dua na ET kacabote (48). Ena ituvatuva ni veimaliwai ena maliwa ni kau kei na herbivores, na cakacaka ni sikinala ni ET ena dinamika ni metabolite ni kau-vakatabakidua e se vakalailai ga ka taketetaka ga e dua na ilawalawa ni veivakaduavatataki. Me kena ikuri, e vuqa na vakadidike era sa vakayagataka na vakayagataki ni exogenous ni ET se na kena ivakavuvuli se veimataqali inhibitors me vulici kina na lawatu ni ET, ena kedra maliwa na vakayagataki ni kemikali exogenous oqo ena vakavuna e vuqa na kena revurevu sega ni vakatabakidua. Me vaka na noda kila, na vuli oqo e matataka na imatai ni vakadidike vakailawalawa levu ni itavi ni ET ena kena vakayagataki na ET me vakatubura ka raica na vakaleqai ni veivunikau transgenic me vakaduavatataka na veivunikau metabolome ni veivunikau. Na veivakayarayarataki ni ET ni manumanu vuka e rawa ni veisautaka na isau ni metabolome. Na kena bibi duadua sai koya na veisautaki ni veisautaki ni ET (ACO) kei na rai (ETR1) na genes ka vakaraitaka na veivakaduiduitaki ni veivakaduiduitaki ni veivakaduiduitaki. Sa vakaraitaki oti ni ET e rawa ni vakavinakataka na JA-vakavuna na nikotini ni vakasoqoni vata ena kena vakalawataki na putrescine N-methylveisau (49). Ia, mai na dua na rai vakamisini, e sega ni matata na sala e vakavinakataka kina na ET na kena vakacurumi na phenamide. Me ikuri ni cakacaka ni veisautaki ni sikinala ni ET, na flux ni metabolic e rawa talega ni shunted ki na S-adenosyl-1-methionine me vakalawataka na vakatubuilavo ena amides ni polyaminophenol. S-adenosyl-1-methionine e ET kei na veimaliwai raraba ni sala ni bula ni polyamine. Na iwalewale e vakalawataka kina na sikinala ni ET na ivakatagedegede ni phenolamide e gadrevi me vulici tale.
Ena dua na gauna balavu, ena vuku ni levu ni metabolites vakatabakidua ni sega ni kilai na ituvatuva, na kauwai kaukauwa ki na veimataqali metabolic vakatabakidua sa sega ni rawa me vakadeitaka vakadodonu na veisau vakayago ni veimataqali metabolic ni oti na veimaliwai ni bula. Ena gauna oqo, yavutaki ena vakadidike ni vakasama ni itukutuku, na vua levu ni MS / MS spectrum rawati yavutaki ena metabolites sega ni veivakaduiduitaki sai koya na manumanu vuka era kania se vakatotomuria na manumanu vuka era tomana tikoga na kena vakalailaitaki na veimataqali metabolic raraba ni metabolome ni draunikau ni vakalevutaka na kena ivakatagedegede ni kena vakatabakidua. Na tubu vakalekaleka oqo ena metabolome vakatabakidua e vakavuna na manumanu vuka e salavata kei na dua na tubu ni veitokoni ena vakatabakidua ni volavola. Na ivakatakilakila e cau vakalevu duadua ki na kena vakatabakidua na metabolome levu cake oqo (e tiko kina e dua na isau cecere ni Si) sa ikoya na metabolite vakatabakidua kei na cakacaka ni herbivorous e vakatakilakilataki taumada. Na ivakaraitaki oqo e salavata kei na parofisai ni vakasama ni OD, ia na parofisai ni MT e semati ki na randomness ni metabolome vakavoutaki e sega ni salavata. Ia, na itukutuku oqo e salavata talega kei na kena tukuni na ivakaraitaki ni veiwaki (MT vinaka duadua; itaba 1B), baleta ni so tale na metabolites sega ni vakatakilakilataki kei na cakacaka ni veitaqomaki sega ni kilai e rawa ni se muria tikoga e dua na veiwaseyaki ni Si random.
E dua na ivakarau vakasakiti e tauri tale mai na vakadidike oqo sai koya mai na ivakatagedegede ni micro-evolution (dua ga na kau kei na iwiliwili ni tavako) ki na dua na ivakatagedegede ni evolution levu cake (veivolekati na veimataqali tavako), duidui na ivakatagedegede ni isoqosoqo ni evolution era tiko ena “itataqomaki vinaka duadua” E tiko na duidui levu ena rawa ni herbivores. Moore kei na so tale. (20) kei Kessler kei Kalske (1) vakatura vakataki koya me veisautaka na tolu na ivakatagedegede ni cakacaka ni veika bula e vakaduiduitaka taumada o Whittaker (50) ki na veisau vakayago ka vakavuna na veisau vakayago ni veimataqali kemikali; o ira na dauvolavola oqo era sega talega ni vakalekalekataka Na iwalewale ni kena kumuni na itukutuku ni metabolome levu talega e sega ni vakamacalataka na sala me vakarautaki kina na veimataqali metabolic mai na itukutuku oqo. Ena vakadidike oqo, na veisau lalai ki na veiwasei ni cakacaka nei Whittaker ena vakasamataka na veimataqali α-metabolic me vaka na duidui ni MS / MS spectra ena dua na kau soli, kei na β-veimataqali me vaka na yavu ni intraspecific ni dua na ilawalawa ni iwiliwili ni tamata Vanua, kei na γ-veimataqali tautauvata ena dua na vakabalavutaki ni veimataqali analysis.
Na sikinala ni JA e bibi me baleta e dua na iwalewale raraba ni veivakabulabulataki ni veivakabulabulataki ni veivakabulabulataki. Ia, e tiko e dua na lailai ni veivakatovolei kaukauwa ni levu ni cau ni lawatu ni JA biosynthesis ki na veimataqali metabolome, kei na kevaka e dua na sikinala ni JA e dua na vanua raraba me baleta na veimataqali metabolic ni lomaocaoca-vakavuna ena dua na ivakatagedegede cecere ni veivakatorocaketaki e se dredre tikoga. Keitou raica ni ituvaki ni kakana draudrau ni Nepenthes kakana draudrau e vakavuna na kena vakatabakidua na metabolome kei na veisau ni kena vakatabakidua na metabolome ena loma ni iwiliwili ni veimataqali Nicotiana kei na maliwa ni veimataqali Nicotiana veivolekati e vakarautaki vakavinaka na kena veiwekani kei na JA vakatakilakila. Me kena ikuri, ni sa vakaleqai na sikinala ni JA, na veivakaduiduitaki ni metabolic e vakavuna e dua na manumanu vuka ni genotype ena bokoci (itaba 3, C kei na E). Me vaka ni veisau ni spectrum ni metabolic ni iwiliwili ni Nepenthes vakayago e vakalevu sara na kena levu, na veisau ni veimataqali β ni metabolic kei na kena vakatabakidua ena vakadidike oqo e rawa ni vakavuna vakalevu na veivakauqeti kaukauwa ni veimataqali veivakaduavatataki vutuniyau ena metabolite. Na kalasi ni veivakaduavatataki oqo e lewa e dua na tiki ni itukutuku ni metabolome ka vakavuna e dua na veiwekani vinaka kei na sikinala ni JA.
Me vaka ni duidui sara na iwalewale ni biochemical ni veimataqali tavako voleka sara, na metabolites e vakatakilakilataki vakatabakidua ena yasa ni ivakarau, sa vakakina na kena vakadidike vakalevu cake. Na itukutuku ni vakasama ni kena vakayagataki na itukutuku ni metabolic e vesu e vakaraitaka ni induction ni herbivorous e vakalevutaka na veivoli ena maliwa ni veimataqali gamma ni metabolic kei na kena vakatabakidua. Na sikinala ni JA e dua na itavi bibi ena veisau oqo. Na tubu ni metabolome vakatabakidua e salavata kei na OD levu ni parofisai ka sa veiwekani vinaka kei na sikinala ni JA, ni sikinala ni JA e veiwekani ca kei na veimataqali gamma ni metabolic. Na ivakaraitaki oqo e vakaraitaka ni OD rawa ni veivunikau e vakatau vakalevu ena plasticity ni JA, se ena dua na ivakatagedegede ni veivakatorocaketaki lailai se ena dua na ivakatagedegede ni veivakatorocaketaki levu cake. Na veivakatovolei ni vakayagataki ni JA e vakavotukanataka na leqa ni biosynthesis ni JA e vakaraitaka tale ni rawa ni vakaduiduitaki na veimataqali tavako era veiwekani voleka ki na veimataqali sikinala-sauma kei na sikinala-sega ni sauma, me vaka ga na nodra ivakarau ni JA kei na palasitika ni metabolome e vakavuna na herbivores. Na veimataqali sega ni sauma na sikinala e sega ni rawa ni sauma ena vuku ni nodra sega ni rawa ni vakatubura na JA endogenous ka ra sa vakatau kina ki na vakaiyalayala ni yago. Oqo e rawa ni vakavuna na veisau ena so na genes bibi ena sala ni sikinala ni JA (AOS kei na JAR4 ena N. crescens) ni. Na kena isau oqo e vakaraitaka ni veivakaduiduitaki oqo ni veimataqali manumanu e rawa ni vakavuna vakalevu na veisau ni rai kei na kena saumi na hormone e loma.
Me ikuri ni veimaliwai ena maliwa ni veivunikau kei na herbivores, na vakadidike ni veimataqali metabolic e semati ki na veivakatorocaketaki bibi kece ni vakasama ena vakadidike ni veisautaki ni bula ki na vanua kei na kena vakatorocaketaki na itovo vereverea ni phenotypic. Ena kena sa tubu na levu ni itukutuku e rawati mai na iyaya ni cakacaka ni MS ni gauna oqo, na veivakatovolei ni vakasama ena veimataqali metabolic e rawa ni sivia na duidui ni metabolite ni tamata yadua / iwasewase ka vakayacora na vakadidike raraba me vakaraitaka na ivakarau sega ni namaki. Ena iwalewale ni vakadidike levu, e dua na vosa vakatautauvata bibi na vakasama ni vakasamataki ni mape vakaibalebale ka rawa ni vakayagataki me vakadikevi kina na itukutuku. O koya gona, e dua na vua bibi ni kena cokovata na gauna oqo ni sega ni veivakaduiduitaki MS / MS metabolomics kei na itukutuku ni vakasama e vakarautaka e dua na metric rawarawa ka rawa ni vakayagataki me tara kina na mape me raica na veimataqali metabolic ena veimataqali ivakarau ni taxonomic. Sa ikoya na yavu ni gadrevi ni iwalewale oqo. Na vuli ni veisau lailai/levu kei na bula ni veivanua.
Ena ivakatagedegede ni macro-veisau, na uto ni vakasama ni veivakatorocaketaki ni kau-manumanu lalai ni Ehrlich kei Raven (51) sai koya me tukuni ni veisau ni veimataqali metabolic ni veimataqali manumanu e vu ni veimataqali ni veimataqali kau. Ia, ena limasagavulu na yabaki mai na kena tabaki na cakacaka seminal oqo, na vakasama oqo e sega soti ni dau vakatovolei (52). Oqo e baleta vakalevu na ivakarau ni phylogenetic ni ivakarau ni metabolic vakatautauvatataki ena veimataqali kau balavu-yawa. Na rarity e rawa ni vakayagataki me vakadeitaka na iwalewale ni vakadidike ni takete. Na gauna oqo ni MS / MS cakacaka e vakayacori ena itukutuku ni vakasama e vakarautaka na MS / MS tautauvata ni ituvatuva ni metabolites sega ni kilai (sega na digidigi ni metabolite taumada) ka veisautaka na MS / MSs oqo ki na dua na ilawalawa ni MS / MS, vakakina ena metabolism vakacakacaka Na ivakaraitaki ni macro-veisau oqo era vakatauvatani ena ivakarau ni veiwasei. Na ivakatakilakila rawarawa ni iwiliwili. Na iwalewale e tautauvata kei na vakadidike ni phylogenetic, ka rawa ni vakayagataka na veitarataravi ni veitarataravi me vakarautaka na iwiliwili ni veimataqali se na itovo ni bula ka sega ni vakasamataki taumada.
Ena ivakatagedegede ni biochemical, na vakasama ni veisele ni Firn kei Jones (53) e vakaraitaka ni veimataqali metabolic e maroroi ena veimataqali ivakatagedegede me vakarautaka na iyaya kaukauwa me vakayagataka na itaviqaravi ni bula ni veika e sega ni veiwekani se vakaisosomitaki taumada. Na iwalewale ni vakasama ni itukutuku e vakarautaka e dua na ituvatuva ena kena rawa ni vakarautaki na veisau oqo ni metabolite-vakatabakidua ka yaco ena gauna ni metabolite vakatabakidua me tiki ni iwalewale ni vakadidike ni bula vakaturi: veisautaki ni bula mai na lailai ni kena vakatabakidua ki na kena cecere na kena vakatabui na metabolites ni dua na vanua e soli.
Na veika kece, ena veisiga taumada ni bula ni molecule, era a vakatorocaketaki na vakasama bibi ni veitaqomaki ni kau, kei na iwalewale ni vakasama-vakauqeti ni deductive e vakasamataki raraba me sala duadua ga ni toso vakasaenisi. Oqo e baleta vakalevu na vakaiyalayala ni tekinolaji ni kena vakarautaki na metabolome taucoko. E dina ga ni iwalewale ni vakasama-vakauqeti e yaga sara vakalevu ena kena digitaki eso tale na iwalewale ni veivakavunau, na nodra rawa ni toso ki liu na noda kila na rede ni biochemical e vakaiyalayala cake mai na iwalewale ni vakasama e tiko ena gauna oqo ena itukutuku-kaukauwa ni saenitisi ni gauna oqo. O koya gona, na vakasama e sega ni rawa ni tukuni rawa e sivia sara na itukutuku e tu, sa sega kina ni rawa ni bokoci na fomula vakasama/vakatovotovo ni toso ena vanua ni vakadidike (4). Eda raica rawa ni cakacaka ni vakasama ni metabolomics e vakacurumi eke e rawa ni vakavotukanataka tale na taleitaka na veika e se qai oti ga oqo (vakacava) kei na iotioti (na cava) na veika ni veimataqali metabolic, ka veivuke ki na dua na gauna vou ni saenitisi ni itukutuku ni veidusimaki vakasama. Na gauna oqo e dikeva tale na vakasama bibi ka vakauqeti ira na itabatamata sa oti.
Na vakani vakadodonu ni manumanu dau kania na co e vakayacori ena kena susugi e dua na ikarua ni larva ni instar se larva ni Sl ena dua ga na draunikau ni pitcher roka vulavula ni dua ga na kau roka rosi, kei na 10 na kau vakatautauvatataki ena dua na kau. Na larvae ni manumanu lalai era a vakacurumi ena clamps, kei na vo ni draunikau era a kumuni ena 24 kei na 72 na auwa ni oti na kena tauvimate ka totolo-vakacegu, ka ra lavetaki na metabolites.
Vakatotomuria na veiqaravi ni manumanu ena dua na ivakarau cecere ni veivakaduavatataki. Na iwalewale e vakayagataki kina na qiqi ni ivakarau ni isulu me vakaduria e tolu na iyatu ni votonikau ena yasana yadua ni midrib ni tolu na draunikau vakarabailevutaki taucoko ni kau ena gauna ni tubu ni isulu garland, ka vakayagataka sara ga na 1:5 Diluted Ms. Se vakayagataka na iqaqalo gloved me vakacuruma na S1 wound ki na. Tamusuka ka vakayagataka e dua na draunikau me vaka e vakamacalataki mai cake. Vakayagataka na iwalewale sa vakamacalataki oti me kauta laivi na metabolites taumada kei na homoni ni kau (54).
Me baleta na kerekere ni JA exogenous, na tolu na draunipetiole ni veitiki yadua ni ono na rosi bulabula ni veimataqali yadua e qaravi ena 20μl ni lanolin vakalivaliva e tiko kina na 150μg MeJA (Lan + MeJA), kei na 20μl ni lanolin vata kei na veiqaravi ni mavoa (Lan + la0no W), se vakayagataka e dua na lewa ni mavoa. Na draunikau era a tamusuki ni oti e 72 na auwa na kena vakayagataki, vakamamacataki ena nitrogen wai, ka maroroi ena -80°C me yacova ni sa vakayagataki.
E va na laini ni veisautaki ni JA kei na ET, oya na irAOC (36), irCOI1 (55), irACO kei na sETR1 (48), sa vakatakilai mai ena noda ilawalawa ni vakadidike. irAOC kaukauwa vakaraitaka e dua na lutu ena JA kei na JA-Ile na ivakatagedegede, ni irCOI1 e sega ni vakasamataki ki na JAs. Ni vakatauvatani kei na EV, e tubu na vakasoqoni vata ni JA-Ile. Vakakina, irACO ena vakalailaitaka na kena buli na ET, ka vakatauvatani kei na EV, sETR1, ka sega ni vakasamataki na ET, ena vakalevutaka na kena buli na ET.
E dua na spectrometer ni leisa ni photoacoustic (Vakasama ni vakasama ETD-300 na gauna dina ni ET vakasama) e vakayagataki me vakayacori kina na ivakarau ni ET sega ni vakacacani. Ni oti ga na veiqaravi, veimama na draunikau era a musuki ka vakadewataki ki na dua na 4-ml vial bilo vakadeitaki, ka vakatarai na headspace me kumuni ena loma ni 5 na auwa. Ena gauna ni veivakatovolei, na vial yadua e vakasavasavataki ena dua na uciwai ni 2 na lita/auwa ni cagi savasava me baleta na 8 na miniti, ka sa sivia oti e dua na catalyst vakarautaka na Sensor Sense me kauta laivi na CO2 kei na wai.
Na itukutuku ni microarray a tabaki taumada ena (35) ka vakabulai ena vanua ni matanitu me baleta na itukutuku ni bula (NCBI) Gene vakaraitaka na itukutuku raraba (na naba ni curu GSE30287). Na itukutuku e veiganiti kei na draunikau e vakavuna na W + OSMs veiqaravi kei na lewa sega ni vakacacani era a lavetaki me baleta na vuli oqo. Na kaukauwa ni kaukauwa e log2. Ni bera na vakadidike ni iwiliwili, na yavu e a veisautaki ka vakatautauvatataki ki na kena ika 75 ni pasede ena kena vakayagataki na R parokaramu ni komipiuta.
Na itukutuku taumada ni RNA ni veitarataravi (RNA-vakatautauvatataki) ni veimataqali Nicotiana a kau mai na NCBI lekaleka ni wiliwili ni itukutuku (SRA), na naba ni cakacaka e PRJNA301787, ka a ripotetaki mai vei Zhou kei na so tale. (39) ka toso me vaka e vakamacalataki ena (56). Na itukutuku kaukauwa e vakayagataki mai vei W + W, W + OSM kei na W + OSS1 veiganiti kei na veimataqali Nicotiana era digitaki me baleta na vakadidike ena vakadidike oqo, ka vakayagataki ena iwalewale oqo: Taumada, na wiliwili kaukauwa ni RNA-seq era a veisautaki ki na ituvatuva ni FASTQ. HISAT2 veisautaka FASTQ ki na SAM, kei na SAMtools veisautaka na faile ni SAM ki na faile ni BAM vakarautaki. StringTie e vakayagataki me vakarautaki kina na gene vakaraitaka, kei na kena iwalewale ni vakaraitaka ni sa tiko na veitikina ena udolu na tikitiki ni yavu ena milioni na tikitiki ni volavola vakatautauvatataki.
Na duru ni veivakacaucautaki (150 mm x 2.1 mm; levu ni tikitiki 2.2μm) vakayagataki ena vakadidike kei na duru ni yadra ni 4 mm x 4 mm e oka kina na iyaya vata ga. Na gradient binary oqo e vakayagataki ena Dionex iotioti ni 3000 cecere ni cakacaka ni wai Chromatography (UHPLC) ivakarau: 0 ki na 0.5 na miniti, isocratic 90% A [wai vakasavasavataki, 0.1% (v/v) acetonitrile kei na 0.05% acetonitrile kei na 0.05% 0,05% na asidi ni fomu); 0.5 ki na 23.5 na miniti, na iwasewase ni gradient e 10% A kei na 90% B, vakatautauvata; 23.5 ki na 25 na miniti, isocratic 10% A kei na 90% B. Na ivakarau ni drodro e 400μl/min. Me baleta na vakadidike kece ni MS, vakacuruma na duru eluent ki na dua na quadrupole kei na gauna-ni-vuka (qTOF) vakadidike vakaiyaragitaki ena dua na ivurevure ni electrospray cakacaka ena ivakarau ni ionization vinaka (vakalivaliva ni kapila, 4500 V; kapila ni katubaleka 130 V ;
Vakayacora na MS / MS tiki ni vakadidike (oqo e vakatokai me MS / MS) e sega ni yaga se sega ni vakaduiduitaki mai na itukutuku me rawati kina na itukutuku ni ituvatuva me baleta na itukutuku raraba ni metabolic e rawa ni laurai. Na vakasama ni sega ni veivakaduiduitaki MS / MS iwalewale e vakararavi ki na dina ni quadrupole e dua na katubaleka ni veivakaduiduitaki levu sara [o koya gona, vakasamataka na veivakaduiduitaki kece ni levu-ki-sausaumi (m / z) sikinala me vaka na veitikitiki]. Ena vuku ni ka oqo, baleta ni sega ni rawa ni bulia na iyaya ni cakacaka ni Impact II e dua na CE tilt, e vica na vakadidike tudei e vakayacori ena kena vakayagataki na vakalevutaki ni veivakacacani-vakavuna na veivakacacani ni veivakacacani (CE) na isau. Me vakalekalekataki, taumada vakadikeva na ivakaraitaki mai na UHPLC-electrospray ionization / qTOF-MS vakayagataka e dua na ivakarau ni spectrometry levu (ituvaki ni veiwasewase lailai e vakatubura na veiwasewase ena-ivurevure), vakadidike mai na m / z 50 ki na 1500 ena dua na tokaruataki ni 5 Hz. Vakayagataka na nitrogen me vaka na kasi ni veicoqacoqa me baleta na MS/MS vakadidike, ka vakayacora na veivakatovolei tudei ena va na duidui ni veicoqacoqa-vakavuna na veivakacacani ni veivakacacani: 20, 30, 40, kei na 50 eV. Ena loma taucoko ni iwalewale ni veivakatovolei, na quadrupole e tiko kina na katubaleka ni veivakaduiduitaki levu duadua, mai na m/z 50 ki na 1500. Ni sa vakarautaki na yago e liu m/z kei na vakatovotovo ni rabailevu ni veivakaduiduitaki ki na 200, na veivakaduiduitaki ni veivakaduiduitaki e vakayacori vakataki koya mai na iyaya ni cakacaka ni parokaramu ni komipiuta kei na 0 Da. Scan me baleta na veitiki ni misa me vaka ena ivakarau ni misa duadua. Vakayagataka na sodium formate (50 na mililita na isopropanol, 200 na mililita na waigaga kei na 1 na mililita na iwali ni wai ni NaOH) me baleta na vakatautauvatataki ni levu. Vakayagataka na ivakarau ni vakatautauvatataki cecere ni Bruker, na faile ni itukutuku e vakatautauvatataki ni oti na kena cici na ivakatautauvata ni spectrum ena dua na gauna soli. Vakayagataka na cakacaka ni vakau ni itukutuku ni vakadidike v4.0 parokaramu ni komipiuta (Brook Dalton, Bremen, Jamani) me veisautaki kina na faile ni itukutuku raw ki na ituvatuva ni NetCDF. Na itukutuku ni MS/MS sa vakabulai ena itukutuku ni metabolomics dolavi MetaboLights (www.ebi.ac.uk) vata kei na naba ni curu. 1471.
MS/MS soqoni e rawa ni vakayacori ena vakadidike ni veiwekani ena maliwa ni MS1 kei na MS/MS sikinala ni ivakarau me baleta na kaukauwa ni coqa lailai kei na cecere kei na lawa vou e vakayacori. Na volavola ni R e vakayagataki me kilai kina na vakadidike ni veiwekani ni veiwasei ni precursor ki na ka e buli, kei na volavola ni C # (
Me rawa ni vakalailaitaki na cala vinaka lasu e vakavuna na rorogo ni taudaku kei na veiwekani lasu e vakavuna na kena kunei eso na ivakatakilakila m/z ena vica walega na ivakaraitaki, eda vakayagataka na “vakasinaiti na cecere” cakacaka ni R pakete XCMS (me baleta na veivakadodonutaki ni rorogo ni taudaku) E dodonu me vakayagataki me sosomitaka na “peteunde” (NA) . Ni sa vakayagataki na cakacaka ni cecere ni vakasinaiti, e se levu tikoga na “0′′ kaukauwa ni isau ena itukutuku ni seti ka na vakaleqa na iwiliwili ni veiwekani. Oti, eda vakatauvatana na itukutuku ni kena vakayacori na isau e rawati ena gauna e vakayagataki kina na cakacaka ni cecere ni vakasinaiti kei na gauna e sega ni vakayagataki kina na cakacaka ni cecere ni vakasinaiti e sega ni vakayagataki na itukutuku ni rorogo corrected oqo kei na kaukauwa ni isau kei na isau ni taudaku e vakarautaki Keitou vakasamataka talega na veika e sivia na kena kaukauwa vakatolu na isau ni taudaku ka raici ira me vaka na “veiulu-ni-vanua dina.” Me baleta na vakasama ni PCC, na m/z ga na sikinala ni ivakaraitaki ni precursor (MS1) kei na itukutuku ni tikitiki ni seti kei na lailai duadua e walu na ulunivanua dina e vakasamataki.
Kevaka na kaukauwa ni ivakarau ni ivakarau ni precursor ena ivakaraitaki taucoko e vakaitamera na kena veiwekani kei na vakalailaitaki ni kaukauwa ni ivakarau ni ivakarau vata ga e vakayacori kina na kaukauwa ni coqa lailai se cecere, kei na ivakarau e sega ni vakatokai me vaka e dua na isotope cecere mai na CAMERA, e rawa ni vakamacalataki tale. Oti, ena kena vakarautaki na veiwatini kece e rawa ni precursor-ka ena loma ni 3 s (na vakasamataki ni gauna ni maroroi ni katubaleka me baleta na maroroi ni cecere), na vakadidike ni veiwekani e vakayacori. Ena gauna ga e lailai kina na m/z na isau mai na isau ni precursor kei na MS/MS veiwasei e yaco ena vanua ni ivakaraitaki vata ga ena itukutuku ni seti me vaka na precursor mai na kena e rawati, e vakasamataki me dua na tikitiki.
Me vaka na rua na lawa rawarawa oqo, eda sega ni okati kina na veitiki ni vakaraitaki kei na m/z na kena isau e levu cake mai na m/z ni ivakatakilakila ni precursor, ka yavutaki ena itutu ni ivakaraitaki e basika kina na precursor kei na tiki ni vakaraitaki. E rawa talega me digitaki na ivakarau ni ivakarau e vakatubura e vuqa na tikitiki ni ivurevure e vakatubura ena ivakarau ni MS1 me vaka na veivakatorocaketaki ni veidigitaki, ka vakavuna kina na redundant MS / MS na veivakaduavatataki. Me rawa ni vakalailaitaka na itukutuku oqo, kevaka e sivia na 0.6 na NDP tautauvata ni spectra, ka ra lewena na chromatogram "ilawalawa pc" vakamacalataki mai na CAMERA, eda na vakaduavatataki ira. Kena itinitini, eda cokovata kece na va na CE na kena isau e salavata kei na precursor kei na veitikitiki ki na iotioti ni deconvoluted na kaukauwa ni kaukauwa cecere duadua ena kedra maliwa na kaukauwa kece ni veidigitaki vata kei na m / z vata ga na kena yaga ena duidui na kaukauwa ni veicoqacoqa. Na ikalawa ni kena vakayacori e tarava e yavutaki ena vakasama ni spectrum ni veivakatautauvatataki ka taura na vakasama na ituvaki duidui ni CE e gadrevi me vakalevutaka na kena rawa ni veiwasei, baleta ni so na veitikina e rawa walega me laurai ena ruku ni dua na kaukauwa ni veicoqacoqa vakatabakidua.
RDPI (30) a vakayagataki me vakarautaki kina na kena rawa ni vakayagataki na itukutuku ni veisau. Na veimataqali spectrum ni metabolic (ivakatakilakila ni Hj) e rawati mai na levu ni MS / MS ni veivakayarayarataki ni vakayagataki na entropy ni Shannon ni MS / MS ni veiwaseyaki ni veivakacacani ni vakayagataki ni veivakatautauvatataki oqo e vakamacalataka o Martínez kei na so tale. (8). Hj = -∑u = 1mPijlog2 (Pij) na vanua e veiganiti kina o Pij kei na kena dau vakawasoma na ikatolu ni MS / MS ena ikatolu ni ivakaraitaki (j = 1, 2,..., m) (au = 1, 2, ..., m) t).
Metabolic vakatabakidua (Si ivakatakilakila) e vakamacalataki me vaka na ivakatakilakila ni vakaraitaki ni dua na MS/MS soli ena kena veiwekani kei na kena dau ena maliwa ni ivakaraitaki e vakasamataki tiko. MS/MS vakatabakidua e vakarautaki me vaka na Si = 1t (∑j = 1tPijPij2PijPi)
Vakayagataka na ivakarau oqo me vakarautaki kina na ivakatakilakila ni δj ni metabolome-vakatabakidua ni ivakaraitaki yadua ni j, kei na ivakatautauvata ni MS/MS vakatabakidua δj = ∑i = 1mPijSi .
MS / MS spectra era sa veitarataravi ena veiwatini, kei na tautauvata e vakarautaki me yavutaki ena rua na sikoa. Taumada, vakayagataka na ivakatagedegede ni NDP (kilai talega me vaka na iwalewale ni veiwekani ni cosine), vakayagataka na ivakatautauvata oqo me sikoa na iwasewase tautauvata ena maliwa ni spectra NDP = (∑iS1 & S2WS1, iWS2, i) 2∑iWS1, i2∑iWS2, i2 na vanua e S1 kei na S2 vinaka me vaka na iWS1,1. i vakaraitaka na bibi e yavutaki ena kaukauwa ni cecere ni duidui ni i-th cecere raraba ena maliwa ni rua na spectra e lailai mai na 0.01 Da. Na bibi e vakarautaki me vaka oqo: W = [kaukauwa cecere] m [vinaka] n, m = 0.5, n = 2, me vaka e vakatura na MassBank.
E dua na ikarua ni iwalewale ni sikoa e vakayacori, ka okati kina na vakadidike ni NL wasei ena maliwa ni MS / MS. Me rawa ni oqo, keitou vakayagataka na 52 lisi ni NL e dau sotavi ena gauna ni MS na iwalewale ni veiwasei ena tandem, kei na NL vakatabakidua cake (faile ni itukutuku S1) ka sa vakamacalataki oti me baleta na MS / MS na ivakarau ni ikarua ni metabolites ni malumalumu Nepenthes mataqali ( 9, 26). Cakava e dua na vector ni 1 kei na 0 me baleta na MS/MS yadua, veiganiti kei na gauna oqo kei na sega ni tiko ni so na NL vakatautauvata. Me vaka na tautauvata ni yawa ni Euclidean, na sikoa ni tautauvata ni NL e vakarautaki me baleta na veiwatini yadua ni vectors ni NL ni binary.
Me vakayacori na veisoqoni ruarua, keitou vakayagataka na R pakete DiffCoEx, ka sa yavutaki ena dua na vakabalavutaki ni vakabibitaki ni gene co-vakamacalataka na vakadidike (WGCNA). Vakayagataka na NDP kei na NL na sikoa ni MS / MS ni MS, keitou vakayagataka na DiffCoEx me vakarautaka na veivakatautauvatataki ni veiwekani ni veivakatautauvatataki. Na ilawalawa ni rua e vakayacori ena kena vakarautaki na "cutreeDynamic" paramita ki na iwalewale = "veivakaduiduitaki", cutHeight = 0.9999, deepSplit = T, kei na minClusterSize = 10. Na R ivurevure ni DiffCoEx a lavetaki mai na ikuri ni faile 1 mai vei Tesson kei na so tale. (57); Na pakete ni parokaramu ni komipiuta e gadrevi R WGCNA e rawa ni kunei ena https.
Me rawa ni vakayacori kina na vakadidike ni rede ni MS / MS, keitou vakarautaka na veitaratara ni spectral vakaveiwatini yavutaki ena NDP kei na mataqali tautauvata ni NL, ka vakayagataka na parokaramu ni komipiuta ni Cytoscape me raica na topology ni rede ena kena vakayagataki na ituvatuva ni veika bula ena CyFilescape yFiles ituvatuva ni algorithm ni vakabalavutaki ni kerekere.
Vakayagataka na R vakadewa 3.0.1 me vakayacori kina na vakadidike ni iwiliwili ena itukutuku. Na bibi ni iwiliwili e vakatovotovotaki ena kena vakayagataki na rua na sala ni vakadidike ni veisau (ANOVA), ka tarava mai na duidui bibi dina ni Tukey (HSD) ni veivakatovolei ni oti na hoc. Me rawa ni vakadikevi na duidui ena maliwa ni veiqaravi ni herbivorous kei na kena lewa, na veiwasei ni rua na iqaqalo ni rua na ilawalawa ni ivakaraitaki vata kei na duidui vata ga e vakadikevi ena kena vakayagataki na veivakatovolei ni gonevuli t.
Me baleta na ikuri ni iyaya me baleta na itukutuku oqo, yalovinaka raica na http.
Oqo e dua na itukutuku ni rawa-ka e dolavi ka veisoliyaki ena ruku ni veivakadonui ni Creative Commons Attribution-Sega ni Veivoli Laiseni, ka vakatara na kena vakayagataki, veisoliyaki kei na kena vakadewataki ena dua na sala, me vaka ga ni iotioti ni kena vakayagataki e sega ni baleta na rawa-ka vakabisinisi kei na premise sa ikoya na cakacaka taumada e dodonu. Ivakatakilakila.
iVakamacala: Keitou kerei iko ga mo vakarautaka na nomu itikotiko ni imeli me rawa kina vua na tamata o vakatura ki na tabana e kila ni o vinakata me ra raica na imeli ka sega ni spam. Eda na sega ni taura e dua na itikotiko ni imeli.
Na taro oqo e vakayagataki me vakatovolei kina se o iko e dua na dausiko vanua ka tarova na vakau ni spam vakataki koya.
Na vakasama ni itukutuku e vakarautaka e dua na ilavo raraba me baleta na veivakatautauvatataki ni metabolomes vakatabakidua kei na parofisai ni vakasama ni veitaqomaki ni veivakatovolei.
Na vakasama ni itukutuku e vakarautaka e dua na ilavo raraba me baleta na veivakatautauvatataki ni metabolomes vakatabakidua kei na parofisai ni vakasama ni veitaqomaki ni veivakatovolei.
©2021 iSoqosoqo ni Amerika me baleta na Toso ni Saenisi. dodonu kece e maroroi. AAAS es un partner de HINARI, AGORA, OARE, CHORUS, CLOCKSS, CrossRef y COUNTER. Na toso ki liu ni saenisi 2375-2548.